More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1777 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  92.12 
 
 
419 aa  686    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  92.36 
 
 
419 aa  686    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  100 
 
 
419 aa  818    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  43.38 
 
 
421 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  34.07 
 
 
391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  36.65 
 
 
400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  36.41 
 
 
400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  32.52 
 
 
380 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  35.7 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  30.9 
 
 
383 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  35.85 
 
 
391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  34.15 
 
 
394 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  29.34 
 
 
374 aa  161  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  28.75 
 
 
375 aa  159  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  30.35 
 
 
374 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  29.68 
 
 
374 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  31.37 
 
 
408 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  33.5 
 
 
385 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  32.39 
 
 
422 aa  154  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  26.85 
 
 
375 aa  153  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  33.65 
 
 
393 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  30.1 
 
 
374 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  30.1 
 
 
374 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  28.4 
 
 
375 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  30.17 
 
 
383 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  30.75 
 
 
381 aa  150  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  29.63 
 
 
374 aa  150  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  28.16 
 
 
374 aa  150  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  29.43 
 
 
374 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  30.93 
 
 
416 aa  149  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  27.25 
 
 
374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  33.09 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  29.18 
 
 
374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  29.18 
 
 
374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  28.33 
 
 
392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  33.65 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  32.61 
 
 
389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  27.93 
 
 
377 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  33.17 
 
 
394 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  29.44 
 
 
379 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  29.8 
 
 
370 aa  144  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  29.63 
 
 
370 aa  143  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  32.93 
 
 
400 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  27.7 
 
 
378 aa  142  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  30.2 
 
 
382 aa  142  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  32.45 
 
 
390 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  32.54 
 
 
427 aa  142  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  34.67 
 
 
429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  28.75 
 
 
376 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  30.73 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  31.99 
 
 
410 aa  140  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  33.41 
 
 
412 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  32.61 
 
 
414 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  32.61 
 
 
414 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  33.65 
 
 
394 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  32.94 
 
 
397 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  32.85 
 
 
418 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  32.13 
 
 
415 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  32.85 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  31.07 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  33.89 
 
 
410 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  30.58 
 
 
408 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  30.92 
 
 
408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  30.92 
 
 
408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  31.78 
 
 
408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  30.92 
 
 
408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  30.58 
 
 
408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  32.37 
 
 
382 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  30.33 
 
 
408 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  34.13 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  32.94 
 
 
425 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  30.96 
 
 
422 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  31.49 
 
 
382 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  31.97 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  33.22 
 
 
300 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  33.22 
 
 
300 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  32.43 
 
 
420 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  26.91 
 
 
334 aa  97.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  26.73 
 
 
339 aa  93.6  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  27.02 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  29.11 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  33.91 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  33.91 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  33.05 
 
 
303 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  29.63 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  32.81 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  29.48 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  27.94 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  29.61 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  30.04 
 
 
313 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.03 
 
 
763 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  29.67 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  31.51 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  29.67 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  31.58 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1398  phospholipase, patatin family  29.78 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.326586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  27.38 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  29.27 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  29.27 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  29.55 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>