More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0420 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0420  patatin  100 
 
 		 397 aa  810    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0379208  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  37.95 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  27.1 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1546  patatin-like phospholipase family protein  29.12 
 
 		 305 aa  86.7  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0945902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1826  patatin family phospholipase  28.02 
 
 		 305 aa  86.3  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2182  patatin  29.14 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  29.73 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0732  Patatin  29.12 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  26.79 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  24.23 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  25.73 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  21.46 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  26.24 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  25.22 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0344  patatin family phospholipase  27.34 
 
 		 285 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  25.22 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  25.79 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1398  phospholipase, patatin family  23.35 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.326586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.71 
 
 		 763 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  23.11 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.09 
 
 		 765 aa  70.5  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  23.32 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2849  phospholipase, patatin family  23.05 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.41074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  25.96 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1068  patatin family phospholipase  23.05 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0343802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  23.01 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  24.19 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  26.48 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  22.32 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2850  Patatin  23.92 
 
 		 299 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000110096  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  25.53 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  24.09 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  24.09 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  23.53 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  24.09 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  25.1 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  25.45 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  27.04 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  26.89 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  23.83 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  23.08 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  25.12 
 
 		 379 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  25.12 
 
 		 379 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  26.18 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  24.45 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  24.31 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  28.57 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  24.02 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  29.3 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  30.3 
 
 		 250 aa  66.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  22.36 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  25.86 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  22.84 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  27.4 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  25.31 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  26.16 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  24.69 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  22.36 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  22.41 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  25.2 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  22.69 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  26.5 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  22.41 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  22.41 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  22.41 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  22.41 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  22.41 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  22.41 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  26.61 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  26.61 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  27.04 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  21.55 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  26.61 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  23.47 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2305  patatin  28.91 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00029553 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  25.48 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  23.56 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3464  patatin  28.91 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102358 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  28.45 
 
 		 740 aa  63.2  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1907  patatin  29.3 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331125  hitchhiker  0.00000758802 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  25.86 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  21.83 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  28.57 
 
 		 728 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  28.37 
 
 		 727 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1747  patatin  28.69 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2977  Patatin  22.18 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  25 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  26.92 
 
 		 283 aa  62  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  29.02 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  23.87 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  24.89 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  25.11 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  26.83 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  27.91 
 
 		 728 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  27.91 
 
 		 728 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  27.91 
 
 		 751 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  26.54 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  22.35 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  27.83 
 
 		 733 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  23.61 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>