274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1094 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  100 
 
 		 381 aa  748    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  58.24 
 
 		 382 aa  441  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  51.47 
 
 		 408 aa  381  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  50.66 
 
 		 393 aa  338  7e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  53.33 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  51.02 
 
 		 422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  53.11 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  52.71 
 
 		 425 aa  335  9e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  48.58 
 
 		 394 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  49.2 
 
 		 385 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  49.08 
 
 		 391 aa  332  6e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  45.21 
 
 		 383 aa  331  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  50.26 
 
 		 389 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  46.97 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  49.74 
 
 		 389 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  52.82 
 
 		 418 aa  324  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  51.29 
 
 		 427 aa  323  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  48.93 
 
 		 408 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  48.93 
 
 		 408 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  48.93 
 
 		 408 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  48.4 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  44.2 
 
 		 375 aa  316  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  44.27 
 
 		 376 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  47.27 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  47.93 
 
 		 408 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  49.2 
 
 		 408 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  45.21 
 
 		 374 aa  311  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  44.92 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  50.9 
 
 		 412 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  48.36 
 
 		 376 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  49.2 
 
 		 408 aa  309  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  45.62 
 
 		 393 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  42.93 
 
 		 377 aa  308  9e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  45.14 
 
 		 374 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  45.14 
 
 		 374 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  45.43 
 
 		 374 aa  306  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  44.74 
 
 		 418 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  45.31 
 
 		 374 aa  306  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  44.59 
 
 		 374 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  42.44 
 
 		 375 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  50.65 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  46.86 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  44.35 
 
 		 374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  44.35 
 
 		 374 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  44.09 
 
 		 374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  48.39 
 
 		 414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  48.39 
 
 		 414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  48.39 
 
 		 415 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  44.33 
 
 		 392 aa  302  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  45.85 
 
 		 390 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  41.6 
 
 		 374 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  47 
 
 		 410 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  47.88 
 
 		 382 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  43.97 
 
 		 374 aa  299  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  43.12 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  40.53 
 
 		 375 aa  296  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  48.19 
 
 		 400 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  46.84 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  46.84 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  47.09 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  42.86 
 
 		 379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  44.13 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  44.13 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  44.06 
 
 		 400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  40.9 
 
 		 391 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  49.5 
 
 		 300 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  49.5 
 
 		 300 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  40.79 
 
 		 416 aa  243  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  43.04 
 
 		 408 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  34.49 
 
 		 370 aa  216  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  34.22 
 
 		 370 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  33.49 
 
 		 421 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  31.67 
 
 		 419 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  30.02 
 
 		 419 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  31.6 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  35.09 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  31.35 
 
 		 377 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  32.14 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  32.76 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  25.99 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  33.89 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  26.16 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  26.72 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  28.28 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  30.08 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  29.71 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0420  patatin  26.48 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0379208  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  32.22 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  30.08 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  30.51 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  30.17 
 
 		 429 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  31.65 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  33.33 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3007  Patatin  29.36 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  30.43 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  28.05 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  28.05 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1353  hypothetical protein  46.88 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  32.09 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0241  hypothetical protein  46.88 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.425412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>