287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2853 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  766    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  99.19 
 
 
370 aa  759    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  35.92 
 
 
374 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  35.19 
 
 
374 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  34.46 
 
 
374 aa  239  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  34.92 
 
 
383 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  35.19 
 
 
375 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  34.83 
 
 
374 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  34.92 
 
 
374 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  34.92 
 
 
374 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  34.83 
 
 
374 aa  238  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  34.83 
 
 
374 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  34.39 
 
 
374 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  36.27 
 
 
408 aa  236  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  34.9 
 
 
377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  34.3 
 
 
374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  33.77 
 
 
400 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  33.86 
 
 
375 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  33.07 
 
 
375 aa  229  8e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  33.51 
 
 
400 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  34.13 
 
 
376 aa  226  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  33.07 
 
 
391 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  33.51 
 
 
374 aa  220  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  35.58 
 
 
382 aa  219  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  34.49 
 
 
381 aa  216  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  33.51 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  32.1 
 
 
378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  33.16 
 
 
393 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  32.28 
 
 
380 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  32.89 
 
 
418 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  34.41 
 
 
408 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  34.41 
 
 
408 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  34.41 
 
 
408 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  34.2 
 
 
394 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  33.33 
 
 
389 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  34.46 
 
 
410 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  33.78 
 
 
414 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  33.78 
 
 
414 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  33.78 
 
 
415 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  33.42 
 
 
422 aa  204  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  33.33 
 
 
463 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  33.68 
 
 
393 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  34.91 
 
 
416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  33.42 
 
 
391 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  33.24 
 
 
410 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  31.75 
 
 
392 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  32.98 
 
 
376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  32.8 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  34.23 
 
 
408 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  33.68 
 
 
394 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  33.87 
 
 
408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  32.36 
 
 
390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  33.6 
 
 
408 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  31.38 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  33.33 
 
 
422 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  32.82 
 
 
427 aa  196  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  32.27 
 
 
382 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  32 
 
 
382 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  33.16 
 
 
385 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  32.27 
 
 
382 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  31.35 
 
 
425 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  33.68 
 
 
397 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  32 
 
 
382 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  33.51 
 
 
412 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  30.95 
 
 
379 aa  186  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  31.46 
 
 
394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  31.35 
 
 
418 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  31.47 
 
 
408 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  28.4 
 
 
421 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  32.64 
 
 
300 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  32.64 
 
 
300 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  29.08 
 
 
400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  29.7 
 
 
419 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  29.7 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  29.63 
 
 
419 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  26.29 
 
 
429 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  26.69 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  26.86 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  26.98 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  32.03 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  30.17 
 
 
403 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  29.13 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  28.88 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  25.38 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  25.08 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  23.85 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  23.85 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  25.38 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  23.85 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  23.85 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  25.38 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  23.85 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  25.38 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  23.85 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  23.85 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  25.38 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  23.85 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  25.45 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  29.15 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  25.17 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>