224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1352 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  100 
 
 		 414 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  100 
 
 		 414 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  100 
 
 		 300 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  100 
 
 		 300 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  100 
 
 		 415 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  98 
 
 		 410 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  86.09 
 
 		 408 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  86.09 
 
 		 408 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  85.76 
 
 		 408 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  85.1 
 
 		 463 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  86.75 
 
 		 408 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  85.76 
 
 		 408 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  86.09 
 
 		 408 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  51.66 
 
 		 391 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  50.33 
 
 		 394 aa  298  9e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  50.17 
 
 		 385 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  49.83 
 
 		 418 aa  291  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  50.17 
 
 		 422 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  47.64 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  46.94 
 
 		 408 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  49.5 
 
 		 381 aa  261  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  48.14 
 
 		 425 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  48.12 
 
 		 410 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  50 
 
 		 394 aa  255  8e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  48.12 
 
 		 422 aa  254  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  49.16 
 
 		 400 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  48.98 
 
 		 412 aa  251  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  46.78 
 
 		 418 aa  246  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  44.48 
 
 		 376 aa  241  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  47.78 
 
 		 397 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  45.76 
 
 		 427 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  42.56 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  44.86 
 
 		 394 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  44.18 
 
 		 390 aa  225  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  44.37 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  43.58 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  42.95 
 
 		 389 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  44.55 
 
 		 389 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  43.24 
 
 		 382 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  42.28 
 
 		 393 aa  219  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  43.24 
 
 		 382 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  43.24 
 
 		 382 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  42.95 
 
 		 408 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  40.14 
 
 		 374 aa  216  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  40.69 
 
 		 383 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  40.69 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  40.69 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  40.69 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  39.53 
 
 		 383 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  40.14 
 
 		 374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  40.14 
 
 		 374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  39.79 
 
 		 374 aa  212  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  39.59 
 
 		 374 aa  209  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  39.38 
 
 		 375 aa  209  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  40.75 
 
 		 374 aa  208  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  39.73 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  38.7 
 
 		 392 aa  205  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  38.51 
 
 		 378 aa  205  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  39.12 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  39.79 
 
 		 377 aa  202  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  36.77 
 
 		 375 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  37.8 
 
 		 374 aa  199  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  40 
 
 		 376 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  39.04 
 
 		 400 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  39.38 
 
 		 400 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  38.57 
 
 		 391 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  37.88 
 
 		 400 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  35.74 
 
 		 416 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  35.69 
 
 		 379 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  32.99 
 
 		 370 aa  158  9e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  32.64 
 
 		 370 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  32 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  34.01 
 
 		 419 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  34.01 
 
 		 419 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  33.56 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  32.65 
 
 		 429 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  31.03 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  34.21 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  32.08 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  26.82 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  29.7 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  30.58 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  31.54 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  29.7 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  26.58 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  27.49 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  30.25 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  28.9 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  30.4 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  30.4 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  30.4 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  30.4 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  30.4 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  29.21 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  30.4 
 
 		 405 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  26.95 
 
 		 385 aa  65.9  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  28.25 
 
 		 427 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  32.07 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  29.2 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  28.57 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>