229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2821 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  81.7 
 
 		 414 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  81.7 
 
 		 415 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  100 
 
 		 408 aa  815    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  94.12 
 
 		 408 aa  752    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  83.42 
 
 		 410 aa  634    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  94.5 
 
 		 463 aa  731    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  93.38 
 
 		 408 aa  771    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  93.63 
 
 		 408 aa  774    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  98.77 
 
 		 408 aa  805    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  93.63 
 
 		 408 aa  774    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  81.7 
 
 		 414 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  85.76 
 
 		 300 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  85.76 
 
 		 300 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  52.09 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  51.44 
 
 		 391 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  51.98 
 
 		 385 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  49.61 
 
 		 418 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  50.94 
 
 		 422 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  45.93 
 
 		 382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  46.12 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  49.2 
 
 		 381 aa  324  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  48.32 
 
 		 412 aa  325  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  44.99 
 
 		 408 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  48.19 
 
 		 394 aa  319  7e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  46.04 
 
 		 418 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  47.91 
 
 		 397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  47.7 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  44.16 
 
 		 410 aa  307  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  44.3 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  44.88 
 
 		 422 aa  296  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  43.83 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  41.42 
 
 		 374 aa  289  7e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  41.16 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  41.16 
 
 		 374 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  41.25 
 
 		 380 aa  283  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  41.73 
 
 		 376 aa  283  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  41.1 
 
 		 374 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  42.75 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  40.68 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  41.75 
 
 		 393 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  42.13 
 
 		 408 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  40.11 
 
 		 374 aa  279  6e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  42.41 
 
 		 393 aa  279  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  39.58 
 
 		 374 aa  278  9e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  42.45 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  40.42 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  41.56 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  40.42 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  40.79 
 
 		 374 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  40.86 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  41.67 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  41.99 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  41.15 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  41.41 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  38.06 
 
 		 375 aa  269  7e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  38.68 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  38.22 
 
 		 375 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  38.32 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  38.26 
 
 		 377 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  38.68 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  38.28 
 
 		 392 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  38.68 
 
 		 376 aa  249  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  38.08 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  36.79 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  37.69 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  37.69 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  37.24 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  34.14 
 
 		 370 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  33.87 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  34.15 
 
 		 416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  32.64 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  31.7 
 
 		 421 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  30.75 
 
 		 419 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  30.75 
 
 		 419 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  30.02 
 
 		 419 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1353  hypothetical protein  66.3 
 
 		 109 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0241  hypothetical protein  66.3 
 
 		 109 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.425412  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  31.96 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  31.4 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  27.16 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  26.84 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  29.06 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  28.11 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  29.6 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  30.8 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  28.28 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  29.37 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  30.2 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  27.82 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  29.17 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  32.35 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  26.25 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  31.65 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  27.24 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  26.71 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  24.29 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  27.24 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  25 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  30.34 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  29.29 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>