217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2295 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0395  patatin  96.34 
 
 		 463 aa  738    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  99.75 
 
 		 408 aa  808    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  82.46 
 
 		 414 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  82.46 
 
 		 415 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  95.59 
 
 		 408 aa  762    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  82.83 
 
 		 410 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  93.38 
 
 		 408 aa  752    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  100 
 
 		 408 aa  810    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  92.89 
 
 		 408 aa  749    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  99.75 
 
 		 408 aa  808    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  82.46 
 
 		 414 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  85.76 
 
 		 300 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  85.76 
 
 		 300 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  52.24 
 
 		 391 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  52.51 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  52.39 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  48.86 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  50.67 
 
 		 422 aa  358  9e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  46.46 
 
 		 382 aa  330  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  49.61 
 
 		 412 aa  329  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  46.5 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  49.74 
 
 		 394 aa  325  6e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  48.93 
 
 		 381 aa  322  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  43.93 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  48.1 
 
 		 400 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  45.5 
 
 		 418 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  48.1 
 
 		 397 aa  308  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  44.78 
 
 		 410 aa  308  8e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  44.81 
 
 		 427 aa  306  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  44.62 
 
 		 422 aa  299  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  41.15 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  43.57 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  41.3 
 
 		 376 aa  280  4e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  39.84 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  39.53 
 
 		 374 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  39.53 
 
 		 374 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  43.77 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  39.79 
 
 		 374 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  42.22 
 
 		 393 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  42.93 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  38.68 
 
 		 374 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  41.24 
 
 		 393 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  42.52 
 
 		 382 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  38.79 
 
 		 374 aa  273  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  39.31 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  41.56 
 
 		 389 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  38.42 
 
 		 374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  38.42 
 
 		 374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  40.71 
 
 		 408 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  39.05 
 
 		 374 aa  270  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  38.05 
 
 		 383 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  42.26 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  42.52 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  41.99 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  37.01 
 
 		 374 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  37.89 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  37.27 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  37 
 
 		 375 aa  260  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  37.63 
 
 		 383 aa  258  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  38.54 
 
 		 392 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  37.87 
 
 		 377 aa  256  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  38.68 
 
 		 376 aa  249  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  37.11 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  38.26 
 
 		 391 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  37.32 
 
 		 400 aa  232  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  37.32 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  37.73 
 
 		 400 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  34.68 
 
 		 370 aa  210  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  34.41 
 
 		 370 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  33.9 
 
 		 416 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  33.68 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  30.43 
 
 		 421 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1353  hypothetical protein  69.57 
 
 		 109 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0241  hypothetical protein  69.57 
 
 		 109 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.425412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  30.43 
 
 		 419 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  30.43 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  29.95 
 
 		 419 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  30.3 
 
 		 429 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  32.08 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  26.95 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  28.75 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  28.1 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  29.73 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  26.62 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  27.46 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  29.06 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  28.97 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  27.87 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  32.07 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  28.33 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  27.07 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  31.91 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  29.06 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  27.33 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  25.78 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  27.14 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  28.45 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  29.75 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  30.74 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  29.91 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>