293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1274 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1274  patatin  100 
 
 		 376 aa  778    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  57.33 
 
 		 383 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  53.12 
 
 		 374 aa  401  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  51.74 
 
 		 374 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  52.03 
 
 		 375 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  52.16 
 
 		 375 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  52.03 
 
 		 375 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  51.62 
 
 		 374 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  51.89 
 
 		 374 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  51.89 
 
 		 374 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  51.22 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  51.62 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  51.62 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  51.62 
 
 		 374 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  51.08 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  51.62 
 
 		 383 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  51.62 
 
 		 374 aa  391  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  50.53 
 
 		 374 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  44.27 
 
 		 381 aa  331  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  41.89 
 
 		 408 aa  311  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  41.55 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  41.49 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  40.5 
 
 		 376 aa  299  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  41.22 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  40.16 
 
 		 393 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  39.89 
 
 		 389 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  40.16 
 
 		 389 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  38.17 
 
 		 378 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  43.7 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  40.05 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  39.36 
 
 		 382 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  38.4 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  40.73 
 
 		 422 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  41.75 
 
 		 412 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  38.83 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  38.62 
 
 		 382 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  38.62 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  37.5 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  37.83 
 
 		 410 aa  265  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  38.68 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  38.52 
 
 		 463 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  38.68 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  38.68 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  38.68 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  38.68 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  38.68 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  37.83 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  37.83 
 
 		 415 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  37.83 
 
 		 414 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  40.31 
 
 		 425 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  38.86 
 
 		 427 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  37.4 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  36.84 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  39.69 
 
 		 410 aa  252  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  36.32 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  36.58 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  37.17 
 
 		 400 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  37.17 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  40.93 
 
 		 418 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  35.62 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  35.25 
 
 		 418 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  39.85 
 
 		 397 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  37.03 
 
 		 422 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  37.24 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  34.39 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  34.13 
 
 		 370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  34.13 
 
 		 379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  37.76 
 
 		 408 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  34.13 
 
 		 416 aa  210  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  40 
 
 		 300 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  40 
 
 		 300 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  27.18 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  28.01 
 
 		 419 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  28.22 
 
 		 419 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  28.64 
 
 		 419 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  27.01 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  29.09 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  27.38 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  25.71 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  26.33 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  23.69 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  24.39 
 
 		 339 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  23.69 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  23.61 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  23.69 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  23.69 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  23.69 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  23.69 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  23.69 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  25.99 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  24.27 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  24.27 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  24.27 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  24.27 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  25.52 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  25.19 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  24.27 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  24.27 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  24.24 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  23.08 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>