170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1160 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  100 
 
 		 400 aa  803    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  58.06 
 
 		 394 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  55.84 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  56.56 
 
 		 425 aa  413  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  54.36 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  55.97 
 
 		 418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  56.61 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  53.47 
 
 		 412 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  53.44 
 
 		 410 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  49.62 
 
 		 382 aa  363  4e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  49.1 
 
 		 463 aa  342  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  48.35 
 
 		 408 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  48.35 
 
 		 408 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  48.33 
 
 		 418 aa  335  7.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  48.35 
 
 		 408 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  47.83 
 
 		 391 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  46.7 
 
 		 394 aa  329  6e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  48.02 
 
 		 422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  48.21 
 
 		 408 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  48.45 
 
 		 381 aa  322  8e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  48.21 
 
 		 410 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  46.75 
 
 		 385 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  47.96 
 
 		 408 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  48.36 
 
 		 408 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  47.95 
 
 		 414 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  47.95 
 
 		 415 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  47.95 
 
 		 414 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  42.42 
 
 		 408 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  44.44 
 
 		 376 aa  302  8.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  43.54 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  42.09 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  42.46 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  42.13 
 
 		 382 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  41.88 
 
 		 382 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  42.28 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  41.18 
 
 		 389 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  41.43 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  38.83 
 
 		 383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  39.75 
 
 		 380 aa  265  8e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  43.37 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  43.37 
 
 		 400 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  39.54 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  39.64 
 
 		 374 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  39.58 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  39.33 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  39.38 
 
 		 374 aa  259  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  37.79 
 
 		 375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  39.38 
 
 		 374 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  39.38 
 
 		 374 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  39.38 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  36.18 
 
 		 375 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  39.02 
 
 		 374 aa  257  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  39.02 
 
 		 374 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  39.02 
 
 		 374 aa  256  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  38.86 
 
 		 374 aa  255  9e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  49.16 
 
 		 300 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  49.16 
 
 		 300 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  40.86 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  35.93 
 
 		 392 aa  252  8.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  38.24 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  36.6 
 
 		 375 aa  250  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  36.34 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  42.49 
 
 		 400 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  35.05 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  37.5 
 
 		 376 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  36.04 
 
 		 378 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  39.55 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  33.67 
 
 		 379 aa  193  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  30.43 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  30.18 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  33.84 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  30.73 
 
 		 421 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  32.69 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  32.39 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  32.39 
 
 		 419 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  34.92 
 
 		 429 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  33.56 
 
 		 420 aa  94  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  31.8 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  31.3 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  26.06 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  26.38 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0241  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.425412  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1353  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  26.53 
 
 		 343 aa  67  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  31.84 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  31.84 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  28.99 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  31.43 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  26.99 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  29.92 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  30.29 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  26.45 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  27.01 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  29.69 
 
 		 382 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  27.65 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  27 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  29.1 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  56.9 
 
 		 375 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3007  Patatin  24.39 
 
 		 331 aa  53.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  27.94 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>