174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4614 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4614  patatin  100 
 
 		 408 aa  818    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  47.7 
 
 		 418 aa  289  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  41.54 
 
 		 463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  41.62 
 
 		 408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  41.71 
 
 		 408 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  40.31 
 
 		 408 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  40.71 
 
 		 408 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  40.71 
 
 		 408 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  40.71 
 
 		 408 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  43.25 
 
 		 410 aa  276  6e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  44 
 
 		 425 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  43.7 
 
 		 412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  43.11 
 
 		 427 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  40.56 
 
 		 418 aa  266  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  40.95 
 
 		 414 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  40.95 
 
 		 414 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  40.95 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  41.24 
 
 		 410 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  42.32 
 
 		 408 aa  257  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  39.9 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  43.54 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  42.17 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  41.48 
 
 		 422 aa  252  8.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  41.24 
 
 		 391 aa  250  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  40.96 
 
 		 422 aa  250  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  41.13 
 
 		 394 aa  249  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  43.04 
 
 		 381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  41.25 
 
 		 385 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  40.55 
 
 		 393 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  39.85 
 
 		 390 aa  240  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  41.43 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  40.31 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  40.56 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  36.69 
 
 		 392 aa  227  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  40.31 
 
 		 382 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  39.29 
 
 		 389 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  38.02 
 
 		 394 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  35.9 
 
 		 374 aa  222  9e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  39.34 
 
 		 389 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  35.82 
 
 		 374 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  35.64 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  35.82 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  39.07 
 
 		 380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  35.9 
 
 		 375 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  35.38 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  40.35 
 
 		 400 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  35.99 
 
 		 374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  34.96 
 
 		 374 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  35.99 
 
 		 375 aa  215  9e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  37.91 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  42.28 
 
 		 300 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  42.28 
 
 		 300 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  36.25 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  35.48 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  33.84 
 
 		 375 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  35.22 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  35.22 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  34.96 
 
 		 374 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  37.5 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  32.73 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  34.96 
 
 		 383 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  35.43 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  36.57 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  34.85 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  34.94 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  34.94 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  34.68 
 
 		 400 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  34.18 
 
 		 416 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  31.39 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  31.22 
 
 		 370 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  31.31 
 
 		 379 aa  159  9e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  32.39 
 
 		 419 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  27.87 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  32.16 
 
 		 419 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  31.78 
 
 		 419 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  32.22 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  32.64 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  30.37 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  26.03 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  25.07 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  28.39 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  28.22 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3007  Patatin  26.29 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  28.93 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  29.32 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  27.27 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  27.27 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  27.27 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  27.27 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  27.27 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  27.27 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  27.27 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  28.85 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  27.08 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  27.63 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  26.53 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  25.1 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  28.3 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  30.31 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  25 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>