220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2250 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  775    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  67.52 
 
 		 422 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  65.9 
 
 		 425 aa  484  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  65.57 
 
 		 418 aa  475  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  63.59 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  61.38 
 
 		 427 aa  461  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  62.15 
 
 		 412 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  61.99 
 
 		 410 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  57.8 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  54.22 
 
 		 382 aa  388  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  51.55 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  53.11 
 
 		 381 aa  354  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  50.26 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  50.13 
 
 		 385 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  49.48 
 
 		 463 aa  342  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  49.74 
 
 		 408 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  49.74 
 
 		 408 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  49.74 
 
 		 408 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  47.44 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  47.81 
 
 		 408 aa  330  3e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  48.98 
 
 		 408 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  48.45 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  48.19 
 
 		 408 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  48.43 
 
 		 414 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  48.43 
 
 		 415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  48.43 
 
 		 414 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  48.43 
 
 		 410 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  47.09 
 
 		 422 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  48.09 
 
 		 393 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  48.7 
 
 		 376 aa  308  9e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  46.33 
 
 		 394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  45.82 
 
 		 393 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  46.17 
 
 		 389 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  45.66 
 
 		 389 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  45.84 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  47.59 
 
 		 382 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  47.72 
 
 		 382 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  43.07 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  47.34 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  47.97 
 
 		 382 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  43.69 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  43.43 
 
 		 374 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  43.43 
 
 		 374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  41.37 
 
 		 383 aa  286  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  42.53 
 
 		 374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  43.7 
 
 		 376 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  42.78 
 
 		 374 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  42.93 
 
 		 374 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  42.53 
 
 		 374 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  42.53 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  42.53 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  42.53 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  41.69 
 
 		 375 aa  275  7e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  40.56 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  39.49 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  40.25 
 
 		 377 aa  272  7e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  39.54 
 
 		 374 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  43.29 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  40.66 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  42.09 
 
 		 400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  42.09 
 
 		 400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  50 
 
 		 300 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  50 
 
 		 300 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  39.02 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  38.23 
 
 		 392 aa  256  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  40.05 
 
 		 391 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  40.91 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  35.37 
 
 		 379 aa  212  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  31.46 
 
 		 370 aa  199  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  31.2 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  34.34 
 
 		 416 aa  170  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  31.28 
 
 		 421 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  32.93 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  33.1 
 
 		 419 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  33.1 
 
 		 419 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  35.25 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  31.78 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  34.75 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  32.13 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0241  hypothetical protein  47.5 
 
 		 109 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.425412  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1353  hypothetical protein  47.5 
 
 		 109 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  23.61 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  27.18 
 
 		 343 aa  67  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  23.28 
 
 		 334 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  28.79 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  30.38 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  28.14 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  26.18 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  29.07 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  28.69 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  27.46 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  30.04 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  27.14 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0420  patatin  26.29 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0379208  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  26.22 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  28.01 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  28 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  28 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  30.66 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3007  Patatin  27.17 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>