More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1286 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1736  patatin  90.84 
 
 		 382 aa  661    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  91.1 
 
 		 382 aa  662    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  91.88 
 
 		 382 aa  700    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  100 
 
 		 382 aa  748    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  77.28 
 
 		 390 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  74.54 
 
 		 394 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  73.75 
 
 		 393 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  71.77 
 
 		 393 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  69.45 
 
 		 389 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  69.19 
 
 		 389 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  48.94 
 
 		 380 aa  344  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  48.02 
 
 		 408 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  44.18 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  47.88 
 
 		 381 aa  299  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  45.84 
 
 		 376 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  43.19 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  40.68 
 
 		 377 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  46.88 
 
 		 391 aa  288  8e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  42.97 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  45.57 
 
 		 394 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  39.47 
 
 		 375 aa  286  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  45.65 
 
 		 385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  39.42 
 
 		 375 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  38.99 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  41.25 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  39.69 
 
 		 374 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  40.73 
 
 		 374 aa  279  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  40.47 
 
 		 374 aa  279  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  40.47 
 
 		 374 aa  278  8e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  47.34 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  40.21 
 
 		 374 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  38.68 
 
 		 375 aa  275  8e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  42.78 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  39.95 
 
 		 374 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  42.52 
 
 		 415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  45.04 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  42.52 
 
 		 414 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  42.52 
 
 		 414 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  39.9 
 
 		 374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  39.9 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  39.9 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  39.69 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  42.63 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  40.52 
 
 		 374 aa  270  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  42.52 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  42.52 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  42.15 
 
 		 463 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  41.99 
 
 		 408 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  45.45 
 
 		 425 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  42.52 
 
 		 408 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  45.94 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  45.32 
 
 		 422 aa  267  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  41.73 
 
 		 408 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  44 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  41.99 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  39.36 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  45.43 
 
 		 418 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  45.09 
 
 		 410 aa  256  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  40.78 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  41.8 
 
 		 400 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  41.8 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  42.42 
 
 		 422 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  42.03 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  37.89 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  41.11 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  41.03 
 
 		 416 aa  236  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  41.43 
 
 		 408 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  43.24 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  43.24 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  32.62 
 
 		 370 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  32.27 
 
 		 370 aa  196  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  31.63 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  31.99 
 
 		 419 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  32.07 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  32.14 
 
 		 419 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  31.9 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  29.8 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  29.71 
 
 		 377 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  25.61 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  28.77 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  27.44 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  26.2 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  30.28 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  28.52 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  26.6 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  29.13 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  25.55 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  25.7 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  29.9 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  29.78 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  35.25 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  28.81 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  28.12 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  28.12 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  28.12 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  28.12 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  28.12 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  28.12 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  28.12 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  29.78 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>