248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2513 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  100 
 
 		 400 aa  777    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  99.75 
 
 		 400 aa  775    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  95 
 
 		 400 aa  728    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  74.74 
 
 		 391 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  42.18 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  40.43 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  44.13 
 
 		 381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  44.06 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  43.39 
 
 		 389 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  42.86 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  39.21 
 
 		 374 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  39.79 
 
 		 379 aa  263  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  39.31 
 
 		 383 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  39.21 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  40 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  40 
 
 		 374 aa  262  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  39.21 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  38.22 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  40.62 
 
 		 418 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  39.74 
 
 		 374 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  39.74 
 
 		 374 aa  260  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  39.74 
 
 		 374 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  40.05 
 
 		 374 aa  259  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  37.43 
 
 		 375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  37.77 
 
 		 375 aa  255  8e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  41.1 
 
 		 376 aa  253  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  38.95 
 
 		 374 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  40.21 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  37.43 
 
 		 374 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  37.4 
 
 		 377 aa  253  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  36.13 
 
 		 375 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  42.71 
 
 		 416 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  40.58 
 
 		 390 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  39.95 
 
 		 393 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  41.8 
 
 		 382 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  40.54 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  41.35 
 
 		 425 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  40.05 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  41.53 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  42.97 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  41.24 
 
 		 422 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  41.11 
 
 		 382 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  40.85 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  39.58 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  42.09 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  35.62 
 
 		 392 aa  242  7e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  40.56 
 
 		 422 aa  242  9e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  43.11 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  42.32 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  36.84 
 
 		 376 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  36.51 
 
 		 383 aa  239  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  39.47 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  41.33 
 
 		 412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  38.21 
 
 		 408 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  38.21 
 
 		 408 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  38.21 
 
 		 408 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  33.77 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  37.95 
 
 		 463 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  33.77 
 
 		 370 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  34.45 
 
 		 378 aa  229  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  38.46 
 
 		 408 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  37.32 
 
 		 427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  37.95 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  37.69 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  36.69 
 
 		 414 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  36.95 
 
 		 415 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  36.86 
 
 		 410 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  35.85 
 
 		 414 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  39.25 
 
 		 300 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  39.25 
 
 		 300 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  34.26 
 
 		 408 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  33.65 
 
 		 421 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  35.68 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  34.89 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  34.64 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  34.36 
 
 		 429 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  32.56 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  31.07 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  25.9 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  30.5 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  30.87 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  25.4 
 
 		 339 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  30.6 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  34.33 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  31.1 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  25.75 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  30.14 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  27.88 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  31.82 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  32.62 
 
 		 313 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  30.08 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  26.72 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0420  patatin  26.92 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0379208  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  28.22 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  29.36 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  28.93 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  29.36 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  30.3 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  28.51 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  28.51 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>