200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0395 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  83.03 
 
 
414 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  95.19 
 
 
408 aa  730    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  83.29 
 
 
410 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  91.13 
 
 
408 aa  721    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  92.86 
 
 
408 aa  748    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  92.91 
 
 
408 aa  722    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  93.1 
 
 
408 aa  750    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  100 
 
 
463 aa  917    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  83.03 
 
 
415 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  83.03 
 
 
414 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  93.1 
 
 
408 aa  750    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  85.1 
 
 
300 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  85.1 
 
 
300 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  52.51 
 
 
391 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  51.68 
 
 
394 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  51.56 
 
 
385 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  49.87 
 
 
418 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  50.67 
 
 
422 aa  359  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  47.99 
 
 
382 aa  338  8e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  46.84 
 
 
425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  48.97 
 
 
412 aa  328  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  49.48 
 
 
394 aa  326  6e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  44.87 
 
 
408 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  48.4 
 
 
381 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  48.84 
 
 
400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  46.31 
 
 
418 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  45.34 
 
 
410 aa  311  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  48.35 
 
 
397 aa  309  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  44.3 
 
 
427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  45.45 
 
 
422 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  41.42 
 
 
374 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  41.1 
 
 
374 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  41.1 
 
 
374 aa  286  5e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  44.36 
 
 
390 aa  285  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  40.26 
 
 
374 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  41.36 
 
 
374 aa  282  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  39.84 
 
 
374 aa  280  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  40.63 
 
 
374 aa  280  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  40 
 
 
374 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  40 
 
 
374 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  40.51 
 
 
380 aa  279  8e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  41.58 
 
 
376 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  41.07 
 
 
408 aa  277  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  39.95 
 
 
374 aa  277  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  39.84 
 
 
383 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  42.12 
 
 
393 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  42.38 
 
 
394 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  41.49 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  42.78 
 
 
382 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  42.67 
 
 
389 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  43.04 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  41.3 
 
 
389 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  42.52 
 
 
382 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  42.26 
 
 
382 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  38.06 
 
 
374 aa  267  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  37.14 
 
 
375 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  39.37 
 
 
392 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  36.87 
 
 
375 aa  263  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  37.86 
 
 
375 aa  262  8e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  37.47 
 
 
377 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  37.37 
 
 
383 aa  259  9e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  38.42 
 
 
376 aa  251  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  37.82 
 
 
391 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  36.34 
 
 
378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  38.54 
 
 
400 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  38.54 
 
 
400 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  37.53 
 
 
400 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  33.51 
 
 
370 aa  206  6e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  33.25 
 
 
370 aa  203  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  34.41 
 
 
416 aa  196  7e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  33.16 
 
 
379 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  30.29 
 
 
421 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0241  hypothetical protein  74.68 
 
 
109 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.425412  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1353  hypothetical protein  74.68 
 
 
109 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  30.46 
 
 
419 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  30.46 
 
 
419 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  30.07 
 
 
419 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  31.27 
 
 
429 aa  100  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  31.62 
 
 
420 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  26.95 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  28.44 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  26.62 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  31.89 
 
 
403 aa  69.7  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  30.08 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  27.81 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  29.67 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  28.28 
 
 
385 aa  63.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  29.55 
 
 
332 aa  63.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  30.74 
 
 
410 aa  63.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  27.21 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  30.64 
 
 
294 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  28.11 
 
 
382 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  27.25 
 
 
399 aa  62.4  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  24.61 
 
 
359 aa  60.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  27.82 
 
 
405 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  27.82 
 
 
405 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  26.38 
 
 
375 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  28.23 
 
 
405 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  28.23 
 
 
405 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  28.23 
 
 
405 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>