220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3832 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3832  patatin  100 
 
 		 418 aa  820    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  77.81 
 
 		 425 aa  605  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  73.87 
 
 		 410 aa  559  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  67.74 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  70.26 
 
 		 412 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  71.1 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  65.57 
 
 		 394 aa  487  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  64.74 
 
 		 422 aa  480  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  55.97 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  53.23 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  52.82 
 
 		 381 aa  352  7e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  49.35 
 
 		 391 aa  346  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  47.62 
 
 		 418 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  48.31 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  48.3 
 
 		 385 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  49.06 
 
 		 422 aa  335  9e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  47.37 
 
 		 463 aa  335  9e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  48.37 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  45.5 
 
 		 408 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  45.5 
 
 		 408 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  45.5 
 
 		 408 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  46.55 
 
 		 408 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  46.8 
 
 		 408 aa  325  7e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  46.56 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  46.04 
 
 		 408 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  44.96 
 
 		 410 aa  316  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  44.39 
 
 		 414 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  44.96 
 
 		 415 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  44.96 
 
 		 414 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  47.7 
 
 		 408 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  45.52 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  44.78 
 
 		 393 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  44.9 
 
 		 389 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  45.11 
 
 		 389 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  44.06 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  45.18 
 
 		 382 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  44.04 
 
 		 376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  45.43 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  42.89 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  45.43 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  43.91 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  42.12 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  42.49 
 
 		 374 aa  274  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  42.12 
 
 		 374 aa  274  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  41.86 
 
 		 374 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  39.79 
 
 		 383 aa  272  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  42.72 
 
 		 391 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  41.07 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  42.12 
 
 		 374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  41.45 
 
 		 374 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  39.64 
 
 		 374 aa  269  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  40.83 
 
 		 375 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  41.19 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  41.19 
 
 		 374 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  41.19 
 
 		 374 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  42.82 
 
 		 400 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  42.82 
 
 		 400 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  40.93 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  39.43 
 
 		 377 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  43.22 
 
 		 400 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  38.86 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  38.66 
 
 		 375 aa  259  8e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  38.92 
 
 		 378 aa  258  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  46.78 
 
 		 300 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  46.78 
 
 		 300 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  38.87 
 
 		 392 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  40.57 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  36.92 
 
 		 379 aa  226  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  31.35 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  31.35 
 
 		 370 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  35.85 
 
 		 416 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  31.04 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  34.57 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  34.34 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  33.17 
 
 		 419 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  36.82 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  35.02 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  31.74 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  27.95 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  24.6 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  24.6 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  27.82 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0241  hypothetical protein  40.86 
 
 		 109 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.425412  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1353  hypothetical protein  40.86 
 
 		 109 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  24.61 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.07 
 
 		 763 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  27.8 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3007  Patatin  26.94 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  30 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  31.85 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  27.11 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  25.67 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  28.98 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  25.77 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  25.9 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  28.04 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  28.71 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  29.62 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  25.59 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  28.28 
 
 		 283 aa  57  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>