More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2865 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2865  patatin  100 
 
 		 374 aa  776    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  76.94 
 
 		 375 aa  614  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  76.2 
 
 		 375 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  76.47 
 
 		 374 aa  609  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  76.01 
 
 		 374 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  75.4 
 
 		 383 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  76.01 
 
 		 374 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  75.34 
 
 		 374 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  75.4 
 
 		 374 aa  597  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  74.6 
 
 		 374 aa  596  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  75.34 
 
 		 374 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  75.74 
 
 		 374 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  75.13 
 
 		 374 aa  597  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  75.07 
 
 		 374 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  70.78 
 
 		 375 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  69.71 
 
 		 377 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  52.41 
 
 		 383 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  51.74 
 
 		 376 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  41.11 
 
 		 408 aa  312  6.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  43.27 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  41.6 
 
 		 381 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  40.11 
 
 		 394 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  39.42 
 
 		 390 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  40.11 
 
 		 393 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  39.89 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  39.74 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  41.42 
 
 		 376 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  40.21 
 
 		 380 aa  279  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  38.74 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  38.42 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  38.48 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  38.32 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  38.32 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  38.83 
 
 		 378 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  38.06 
 
 		 463 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  38.06 
 
 		 408 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  38.89 
 
 		 392 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  37.63 
 
 		 382 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  37.37 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  37.27 
 
 		 408 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  37.27 
 
 		 408 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  37.01 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  36.15 
 
 		 410 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  39.59 
 
 		 427 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  40.41 
 
 		 410 aa  258  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  35.62 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  35.62 
 
 		 414 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  40.46 
 
 		 397 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  40.66 
 
 		 425 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  35.62 
 
 		 414 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  37.4 
 
 		 400 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  36.6 
 
 		 391 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  38.54 
 
 		 422 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  37.14 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  35.94 
 
 		 394 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  39.54 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  35.42 
 
 		 418 aa  249  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  37.11 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  36.24 
 
 		 385 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  35.42 
 
 		 391 aa  245  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  38.4 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  34.83 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  39.64 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  34.56 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  35.39 
 
 		 422 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  33.24 
 
 		 379 aa  226  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  34.79 
 
 		 400 aa  225  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  34.74 
 
 		 416 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  37.8 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  37.8 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  32.99 
 
 		 408 aa  202  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  30.15 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  27.52 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  27.52 
 
 		 419 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  26.75 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  26.61 
 
 		 429 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  25.86 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  27.99 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  26.1 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  28.52 
 
 		 343 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  26.94 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  25.86 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  26.35 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  26.62 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  32.02 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  24.43 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  25.49 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  25.87 
 
 		 291 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  25.08 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  28.37 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  25.15 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  25.82 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  26.28 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  24.92 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  29.3 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  28.41 
 
 		 303 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  23.72 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  29.44 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  24.85 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  23.8 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>