299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2472 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  100 
 
 		 408 aa  831    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  52.09 
 
 		 382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  51.47 
 
 		 381 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  49.87 
 
 		 393 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  49.87 
 
 		 390 aa  346  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  47.34 
 
 		 376 aa  343  4e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  48.81 
 
 		 382 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  47.92 
 
 		 389 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  47.92 
 
 		 389 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  48.02 
 
 		 382 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  48.41 
 
 		 393 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  48.15 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  48.02 
 
 		 382 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  47.76 
 
 		 382 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  46.09 
 
 		 463 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  43.85 
 
 		 380 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  43.93 
 
 		 408 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  43.93 
 
 		 408 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  43.93 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  45.48 
 
 		 374 aa  317  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  43.88 
 
 		 375 aa  315  8e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  42.29 
 
 		 375 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  43.58 
 
 		 375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  44.15 
 
 		 392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  47.81 
 
 		 394 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  44.65 
 
 		 394 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  42.36 
 
 		 383 aa  309  5.9999999999999995e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  44.2 
 
 		 408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  44.99 
 
 		 408 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  41.29 
 
 		 374 aa  306  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  44.09 
 
 		 385 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  44.65 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  41.55 
 
 		 377 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  43.87 
 
 		 408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  46.79 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  41.96 
 
 		 418 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  42.2 
 
 		 374 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  47.37 
 
 		 418 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  42.04 
 
 		 383 aa  302  9e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  43.01 
 
 		 374 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  47.51 
 
 		 410 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  42.78 
 
 		 374 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  42.78 
 
 		 374 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  42.59 
 
 		 374 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  42.59 
 
 		 374 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  43.22 
 
 		 410 aa  299  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  41.89 
 
 		 376 aa  298  9e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  44.62 
 
 		 422 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  42.97 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  42.09 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  42.97 
 
 		 415 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  42.97 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  42.05 
 
 		 374 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  42.74 
 
 		 374 aa  296  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  45.8 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  43.04 
 
 		 374 aa  293  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  46.92 
 
 		 397 aa  292  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  42.16 
 
 		 400 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  40.53 
 
 		 400 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  40.53 
 
 		 400 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  39.37 
 
 		 391 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  40.85 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  42.93 
 
 		 427 aa  279  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  45.41 
 
 		 412 aa  277  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  46.94 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  46.94 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  42.32 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  36.51 
 
 		 379 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  36.53 
 
 		 370 aa  239  8e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  36.27 
 
 		 370 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  35.79 
 
 		 416 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  30.62 
 
 		 421 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  29.98 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  29.48 
 
 		 419 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  30.39 
 
 		 419 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  28.13 
 
 		 429 aa  116  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  28.12 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  27.07 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  27.8 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  26.2 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  27.76 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  26.46 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  26.04 
 
 		 343 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  27.02 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  27.12 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  24.93 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  23.84 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  28.82 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  25.51 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  26.91 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  30.33 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  27.8 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1398  phospholipase, patatin family  40.86 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.326586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  27.35 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  26.87 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  27.64 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  27.16 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.87 
 
 		 763 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  27.06 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  27.23 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>