291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2615 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2615  patatin  100 
 
 		 374 aa  777    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  77.48 
 
 		 375 aa  619  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  77.01 
 
 		 375 aa  616  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  76.94 
 
 		 374 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  77.75 
 
 		 374 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  77.75 
 
 		 374 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  78.02 
 
 		 374 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  75.87 
 
 		 374 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  75.94 
 
 		 374 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  76.41 
 
 		 375 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  75.6 
 
 		 374 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  75.67 
 
 		 374 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  75.94 
 
 		 374 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  75.87 
 
 		 383 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  75.07 
 
 		 374 aa  591  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  72.46 
 
 		 377 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  54.55 
 
 		 383 aa  414  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  53.12 
 
 		 376 aa  401  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  45.48 
 
 		 408 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  45.31 
 
 		 381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  45.16 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  42.63 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  40.94 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  41.36 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  41.15 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  42.28 
 
 		 376 aa  289  5.0000000000000004e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  41.41 
 
 		 389 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  40.42 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  40.42 
 
 		 408 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  40.42 
 
 		 408 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  40.05 
 
 		 408 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  40.05 
 
 		 408 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  40.37 
 
 		 380 aa  285  9e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  39.79 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  40.52 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  38.85 
 
 		 393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  39.21 
 
 		 394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  39.05 
 
 		 410 aa  280  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  40.52 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  38.79 
 
 		 414 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  38.79 
 
 		 415 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  38.79 
 
 		 414 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  40.52 
 
 		 382 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  40.26 
 
 		 382 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  42.12 
 
 		 422 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  39.15 
 
 		 392 aa  269  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  38.95 
 
 		 400 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  42.71 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  38.68 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  37.43 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  40.82 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  38.22 
 
 		 400 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  36.91 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  40.66 
 
 		 410 aa  252  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  37.63 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  40.05 
 
 		 427 aa  250  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  36.58 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  39.69 
 
 		 412 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  39.07 
 
 		 400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  39.59 
 
 		 425 aa  246  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  36.39 
 
 		 418 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  36.97 
 
 		 385 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  40.57 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  33.78 
 
 		 370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  33.51 
 
 		 370 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  35.75 
 
 		 422 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  36.29 
 
 		 416 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  33.6 
 
 		 379 aa  225  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  35.22 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  39.86 
 
 		 300 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  39.86 
 
 		 300 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  32.6 
 
 		 421 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  27.43 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  27.79 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  27.79 
 
 		 419 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  31.49 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  26.18 
 
 		 420 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  25.27 
 
 		 343 aa  89.4  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  24.46 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  27.95 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  29.76 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  27.46 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  27.19 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  31.14 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  25.69 
 
 		 339 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  30.43 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  23.81 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  25.48 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  25.86 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3007  Patatin  24.07 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  25.96 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  24.86 
 
 		 379 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  28.02 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  25.59 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  26.07 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  23.36 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  25.59 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  25.59 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  25.59 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  25.59 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>