188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0775 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0775  patatin  100 
 
 		 351 aa  677    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  69.19 
 
 		 411 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  44.66 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0044  Patatin  34.38 
 
 		 309 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  29.47 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  28.61 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  35.83 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  27.38 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  33.7 
 
 		 288 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  34.48 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  34.05 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  34.05 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  32.78 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  30.52 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  35.05 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  31.39 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  26.27 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  27.95 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  31.47 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  26.51 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3556  Patatin  39.06 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  37.27 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  29.43 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  25.62 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  28.52 
 
 		 727 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  28.67 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  30.9 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  33.47 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  29.24 
 
 		 276 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  27 
 
 		 733 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3330  Patatin  29.64 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  27.38 
 
 		 728 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  27.38 
 
 		 751 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  27.38 
 
 		 728 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  28.96 
 
 		 728 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  31.97 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  27.92 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  30.56 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  42.25 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  28.07 
 
 		 760 aa  59.7  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  27.62 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  28.23 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  28.23 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  25.89 
 
 		 728 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  29.55 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  30.56 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  30.09 
 
 		 316 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  27.52 
 
 		 728 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2182  patatin  23.72 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  27.23 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  28.7 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  28.77 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  28.77 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  29.58 
 
 		 745 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  27.84 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.01 
 
 		 624 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  29.75 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  30.98 
 
 		 313 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  28.91 
 
 		 330 aa  53.5  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  30.87 
 
 		 748 aa  53.1  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  24.51 
 
 		 303 aa  53.1  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  29.3 
 
 		 358 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  29.11 
 
 		 315 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  30.45 
 
 		 767 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  24.18 
 
 		 923 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  27.56 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1401  patatin  20.2 
 
 		 264 aa  52.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0324222  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  27.27 
 
 		 293 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  29.96 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  30.99 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  25 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  27.48 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  23.97 
 
 		 741 aa  50.8  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  29.95 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2060  patatin  27.8 
 
 		 368 aa  51.2  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  26.77 
 
 		 303 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  26.21 
 
 		 273 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  26.27 
 
 		 738 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  26.27 
 
 		 738 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  29.36 
 
 		 798 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  28.7 
 
 		 796 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  28.87 
 
 		 259 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  27.15 
 
 		 263 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  25.63 
 
 		 754 aa  50.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  29.6 
 
 		 345 aa  49.7  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  23.75 
 
 		 256 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  25.48 
 
 		 739 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  29.38 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.29 
 
 		 748 aa  49.7  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  29.51 
 
 		 667 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  31.96 
 
 		 320 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  24.19 
 
 		 259 aa  49.7  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  27.07 
 
 		 263 aa  49.3  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  28.64 
 
 		 317 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  26.27 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2443  Patatin  28.1 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  27.51 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  29.41 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  26.27 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  26.1 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>