22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2060 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2060  patatin  100 
 
 		 368 aa  753    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  28.03 
 
 		 276 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  26.82 
 
 		 296 aa  86.7  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  33.94 
 
 		 283 aa  85.9  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  27.22 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  32.21 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  31.65 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  28.25 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  30.56 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  26.82 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  29.61 
 
 		 301 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  26.82 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2443  Patatin  26.5 
 
 		 299 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  23.29 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  24.71 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  25.94 
 
 		 288 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  29.25 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  27.8 
 
 		 351 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  23.49 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0785  alpha-beta hydrolase family esterase  31.07 
 
 		 145 aa  46.2  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0921581  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3330  Patatin  50 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  25.42 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>