230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4688 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4688  patatin  100 
 
 		 288 aa  566  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  79.51 
 
 		 288 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  69.61 
 
 		 301 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  69.61 
 
 		 301 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  69.26 
 
 		 301 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  64.93 
 
 		 294 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  41.11 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  42.01 
 
 		 283 aa  162  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  35.14 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  36.4 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  39.78 
 
 		 283 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  38.62 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  36.24 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  36.5 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1643  Patatin  36.48 
 
 		 271 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  41.1 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3330  Patatin  32.12 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  33.7 
 
 		 351 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  30.14 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  32.35 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  32.72 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2443  Patatin  31.99 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  32 
 
 		 748 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  31.51 
 
 		 394 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  44.74 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  29.51 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  30.77 
 
 		 803 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  30.77 
 
 		 803 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  30.77 
 
 		 803 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2060  patatin  25.94 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  26.52 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  29.96 
 
 		 411 aa  58.9  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  40.45 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1690  Patatin  30.8 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  28.03 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  36.19 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  28.43 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  30.77 
 
 		 796 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  30.77 
 
 		 798 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  34.83 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  34.83 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  32.66 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  39 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  31.6 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  31.5 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  40.28 
 
 		 741 aa  55.8  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  41.05 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  30.1 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  28.57 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  46.05 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  46.05 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  29.89 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  29.77 
 
 		 804 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  37.89 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0044  Patatin  30.88 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  29.22 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  41.67 
 
 		 745 aa  53.1  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  44.93 
 
 		 263 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  40.79 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  29.72 
 
 		 253 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  27.39 
 
 		 397 aa  52.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  44.93 
 
 		 263 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  37.08 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  37.08 
 
 		 308 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  37.08 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  37.08 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  44.93 
 
 		 263 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  24.66 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  28.7 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  29.17 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  29.95 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  37.5 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  39.47 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  28.75 
 
 		 767 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  37.08 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  27.52 
 
 		 413 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  37.08 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  27.75 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  24.52 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  35.87 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  35.87 
 
 		 474 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  33 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  33.68 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  30 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  26.34 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  35.87 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  29.78 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  35.87 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  35.87 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  35.87 
 
 		 347 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  35.87 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  28.43 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  43.48 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  43.48 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  43.48 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  43.48 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  38.03 
 
 		 667 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  39.71 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  30.77 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  43.48 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>