49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0044 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0044  Patatin  100 
 
 		 309 aa  597  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  34.65 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  35.05 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  31.61 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  31.7 
 
 		 394 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  28.01 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  30.08 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  31.7 
 
 		 398 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3556  Patatin  36.43 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  30.33 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  30.41 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  27.43 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  33.04 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  30.11 
 
 		 283 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  31.86 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  28.67 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  30.86 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  31.05 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  29.58 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  29.5 
 
 		 728 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  31.21 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  41.79 
 
 		 728 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  39.71 
 
 		 751 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  29.55 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  39.71 
 
 		 727 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  39.71 
 
 		 728 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  30.52 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  39.71 
 
 		 728 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  28.44 
 
 		 420 aa  46.2  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  38.24 
 
 		 728 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  37.33 
 
 		 741 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  30.74 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  30.74 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  24.92 
 
 		 413 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  38.24 
 
 		 733 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  35.62 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  30.19 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  35.64 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  30.73 
 
 		 345 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  28.57 
 
 		 259 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  34.65 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  40.74 
 
 		 745 aa  43.1  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  26.5 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  28.04 
 
 		 875 aa  42.7  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  25.24 
 
 		 894 aa  42.7  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  32.63 
 
 		 667 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  40 
 
 		 308 aa  42.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  25.41 
 
 		 397 aa  42.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  30.58 
 
 		 707 aa  42.4  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>