66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1643 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1643  Patatin  100 
 
 		 271 aa  525  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  37.37 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  38.3 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  38.3 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  39.64 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  37.5 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  36.67 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  40.77 
 
 		 283 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  36.4 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  35.76 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  37.41 
 
 		 331 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  35.29 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  31.4 
 
 		 288 aa  95.5  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  33.86 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  34.11 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2443  Patatin  37.16 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  38.4 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3330  Patatin  30.82 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  30.74 
 
 		 351 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  28.57 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  28.57 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  29.77 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  29.88 
 
 		 322 aa  52  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  31.22 
 
 		 323 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  30.95 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  30.95 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  29.08 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  28.22 
 
 		 746 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  26.9 
 
 		 318 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  24.79 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  32.7 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  30.69 
 
 		 303 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  29.81 
 
 		 347 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  27.83 
 
 		 349 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0785  alpha-beta hydrolase family esterase  39.74 
 
 		 145 aa  46.6  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0921581  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  40.28 
 
 		 420 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  32.62 
 
 		 314 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2060  patatin  30.28 
 
 		 368 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  29.81 
 
 		 347 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  28.17 
 
 		 474 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  28.17 
 
 		 347 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  25.91 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  29.81 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  31.58 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  31.38 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  27.23 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  27.23 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  28.85 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  30.6 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  28.85 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  27.23 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  29.51 
 
 		 346 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  29.47 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  29.82 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  29.47 
 
 		 358 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  46.55 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  28.85 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  25.65 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  29.95 
 
 		 346 aa  43.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  30 
 
 		 334 aa  43.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  35.96 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  29.86 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  32.45 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  31.22 
 
 		 346 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  27.23 
 
 		 327 aa  42.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  30.35 
 
 		 320 aa  42  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>