196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7582 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7582  Patatin  100 
 
 		 331 aa  656    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  46.15 
 
 		 351 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  42.36 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0044  Patatin  35.95 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  31.85 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  36.33 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  34.96 
 
 		 294 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  31.88 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  28.28 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  34.19 
 
 		 288 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  35.81 
 
 		 301 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  35.37 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  35.37 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  28.66 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  29.83 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  27.08 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  32.88 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  30.08 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3556  Patatin  51.56 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  25 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  30.29 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  33.17 
 
 		 276 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  29.55 
 
 		 798 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  25.84 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  29.55 
 
 		 796 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  35.29 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  33.48 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  29.55 
 
 		 803 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  29.55 
 
 		 803 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  29.55 
 
 		 803 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  29.87 
 
 		 813 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  29.55 
 
 		 804 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  28.52 
 
 		 933 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  30.31 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  28.52 
 
 		 945 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  30.34 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  28.52 
 
 		 728 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  28.52 
 
 		 920 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  28.52 
 
 		 930 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  31.84 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  30.71 
 
 		 852 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  30.67 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  31.2 
 
 		 728 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  28 
 
 		 751 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3330  Patatin  29.12 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  32.46 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  30 
 
 		 728 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  27.68 
 
 		 714 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  30 
 
 		 728 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  29.91 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  30.67 
 
 		 728 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  30.17 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  33.47 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  32.48 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  39.19 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  32.89 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  28.9 
 
 		 754 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  31.14 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  29.74 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  26.84 
 
 		 728 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  30 
 
 		 727 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  33.48 
 
 		 748 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  32.48 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  29.82 
 
 		 474 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  31.11 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  31.22 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  29.92 
 
 		 667 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  31.22 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  31.22 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  30.77 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  29.91 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  30.77 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1381  hypothetical protein  24.52 
 
 		 883 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1377  hypothetical protein  24.42 
 
 		 883 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30.22 
 
 		 253 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  29.46 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  29.46 
 
 		 306 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  30.56 
 
 		 247 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  29.46 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  26.76 
 
 		 894 aa  53.1  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  25.95 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2060  patatin  28.57 
 
 		 368 aa  53.1  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1643  Patatin  28.51 
 
 		 271 aa  53.1  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  29.86 
 
 		 330 aa  53.1  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  29.46 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  27.64 
 
 		 740 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  29.46 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  29.52 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  32.13 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  29.46 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  32.2 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  38.81 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  38.24 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  28.26 
 
 		 767 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  28.69 
 
 		 377 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  41.18 
 
 		 741 aa  50.4  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  28.57 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  32.58 
 
 		 707 aa  50.8  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  26.07 
 
 		 720 aa  50.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  30.52 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>