256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1377 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1381  hypothetical protein  98.07 
 
 
883 aa  1804    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1377  hypothetical protein  100 
 
 
883 aa  1835    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2334  hypothetical protein  29.98 
 
 
665 aa  196  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2479  hypothetical protein  25.38 
 
 
661 aa  185  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  29.81 
 
 
740 aa  85.9  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  28.05 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  30.05 
 
 
760 aa  79.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  26.52 
 
 
740 aa  78.6  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  29.65 
 
 
339 aa  77  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  26.83 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  31.05 
 
 
734 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  27.5 
 
 
738 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  26.17 
 
 
520 aa  71.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  22.69 
 
 
357 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.26 
 
 
624 aa  70.5  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  29.03 
 
 
410 aa  70.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  30.32 
 
 
738 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  30.32 
 
 
738 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  24.57 
 
 
923 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  24.65 
 
 
301 aa  70.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  25.11 
 
 
251 aa  70.1  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  26.96 
 
 
735 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  27.85 
 
 
728 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  27.8 
 
 
738 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  27.04 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  27.35 
 
 
728 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  28.77 
 
 
754 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  27.23 
 
 
727 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  25.53 
 
 
343 aa  67  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  26.06 
 
 
387 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  27.59 
 
 
894 aa  67  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  23.05 
 
 
321 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  28.51 
 
 
739 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  29.41 
 
 
736 aa  65.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  23.28 
 
 
321 aa  66.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  23.28 
 
 
321 aa  66.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  23.28 
 
 
321 aa  66.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  23.28 
 
 
321 aa  66.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  23.28 
 
 
321 aa  66.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  23.05 
 
 
321 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  25.81 
 
 
746 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  26.6 
 
 
775 aa  65.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  25.96 
 
 
400 aa  65.5  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  25.47 
 
 
751 aa  65.5  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  29.74 
 
 
621 aa  64.7  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  28.96 
 
 
767 aa  64.7  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  27.94 
 
 
252 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  28.63 
 
 
387 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  26.32 
 
 
250 aa  63.5  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01322  Patatin  22.47 
 
 
296 aa  63.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  28.77 
 
 
737 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  26.24 
 
 
728 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  27.64 
 
 
335 aa  63.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  28.77 
 
 
738 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  27.16 
 
 
737 aa  63.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  28.77 
 
 
738 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  25.35 
 
 
751 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  25.6 
 
 
334 aa  62.4  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  26.72 
 
 
707 aa  62.8  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  25.62 
 
 
728 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  24.61 
 
 
323 aa  62.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  26.51 
 
 
728 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  26.5 
 
 
293 aa  62  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  25.13 
 
 
276 aa  62  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  28.77 
 
 
737 aa  62  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  26.32 
 
 
247 aa  62.4  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  25.12 
 
 
294 aa  62  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  26.34 
 
 
753 aa  61.6  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  23.23 
 
 
298 aa  61.6  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  28.3 
 
 
738 aa  61.6  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  26.04 
 
 
302 aa  61.2  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12074  transmembrane protein  25.53 
 
 
324 aa  61.2  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  25.37 
 
 
875 aa  60.8  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  27.65 
 
 
399 aa  60.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  23.44 
 
 
741 aa  60.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  29.25 
 
 
386 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  26.92 
 
 
796 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51530  ExoU  26.49 
 
 
687 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167383  hitchhiker  0.000105618 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  27.94 
 
 
735 aa  60.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  26.27 
 
 
293 aa  59.7  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  26.6 
 
 
798 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  25.87 
 
 
263 aa  59.3  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  27.18 
 
 
803 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  26.92 
 
 
803 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  25 
 
 
263 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  26.92 
 
 
803 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  25.14 
 
 
317 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  28.37 
 
 
382 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  21.46 
 
 
909 aa  58.9  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  23.89 
 
 
308 aa  58.9  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  22.86 
 
 
326 aa  58.9  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  26.46 
 
 
280 aa  58.5  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  22.11 
 
 
327 aa  58.5  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1205  patatin  23.64 
 
 
279 aa  58.2  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  25.96 
 
 
790 aa  58.2  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  26.47 
 
 
667 aa  57.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  26.05 
 
 
379 aa  57  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  23.55 
 
 
358 aa  57.4  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  28.14 
 
 
363 aa  57.4  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  24.12 
 
 
302 aa  57  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>