125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2479 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2479  hypothetical protein  100 
 
 
661 aa  1365    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2334  hypothetical protein  95.49 
 
 
665 aa  1276    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1377  hypothetical protein  25.56 
 
 
883 aa  193  8e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1381  hypothetical protein  25.26 
 
 
883 aa  188  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  27.62 
 
 
339 aa  98.2  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  23.36 
 
 
357 aa  87.8  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  25.46 
 
 
321 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  25.46 
 
 
321 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  25.46 
 
 
321 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  25.46 
 
 
321 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  25.46 
 
 
321 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  24.67 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2888  hypothetical protein  24.68 
 
 
615 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  24.4 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  21.64 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1235  hypothetical protein  25.44 
 
 
579 aa  72.8  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0660  Patatin  27.4 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.78646 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1235  hypothetical protein  24.91 
 
 
579 aa  70.5  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  22.19 
 
 
343 aa  69.3  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  27.16 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  27.59 
 
 
321 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  26.09 
 
 
520 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  25.56 
 
 
740 aa  64.3  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51530  ExoU  22.92 
 
 
687 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167383  hitchhiker  0.000105618 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3042  patatin  24.39 
 
 
586 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  24.38 
 
 
738 aa  62  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  21.01 
 
 
293 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  26.17 
 
 
247 aa  60.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  24.79 
 
 
738 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  26.48 
 
 
251 aa  59.3  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  23.77 
 
 
740 aa  58.9  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  24.79 
 
 
738 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  24.79 
 
 
737 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  24.79 
 
 
738 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  26.72 
 
 
406 aa  58.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  25.31 
 
 
754 aa  57.8  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  25.31 
 
 
735 aa  57.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  24.31 
 
 
760 aa  57.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01322  Patatin  20.18 
 
 
296 aa  57.4  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  22.81 
 
 
317 aa  57.4  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  23.71 
 
 
734 aa  57  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  25.42 
 
 
737 aa  55.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  23.25 
 
 
741 aa  55.8  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1382  patatin  23.04 
 
 
374 aa  55.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  24.38 
 
 
738 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  24.38 
 
 
738 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  25.11 
 
 
728 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  24.88 
 
 
256 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1205  patatin  23.38 
 
 
279 aa  54.3  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  25.33 
 
 
263 aa  54.3  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  26.34 
 
 
343 aa  54.3  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0819  alpha-beta hydrolase superfamily esterase  25.78 
 
 
339 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  27.24 
 
 
359 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  24.79 
 
 
739 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  22.22 
 
 
751 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  23.14 
 
 
736 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  26.36 
 
 
444 aa  53.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  36.62 
 
 
728 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  24.15 
 
 
738 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  22.97 
 
 
267 aa  52.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  22.22 
 
 
728 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  22.86 
 
 
727 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  22.22 
 
 
728 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  25.68 
 
 
751 aa  52  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1690  Patatin  21.12 
 
 
289 aa  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3038  putative exported phospholipase, patatin-like  24.2 
 
 
274 aa  52  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000229451  unclonable  0.00000199426 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  24.9 
 
 
737 aa  52  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1855  patatin  27.16 
 
 
321 aa  51.2  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12074  transmembrane protein  22.37 
 
 
324 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  24.14 
 
 
728 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  24.42 
 
 
241 aa  51.2  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  24.61 
 
 
341 aa  50.8  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  25.73 
 
 
318 aa  50.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0190  Patatin  23.87 
 
 
314 aa  50.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  23.79 
 
 
275 aa  50.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  26.27 
 
 
346 aa  50.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6376  patatin  46.27 
 
 
444 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.103764  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  24.66 
 
 
252 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  25.11 
 
 
398 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  45.65 
 
 
1048 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  22.97 
 
 
275 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  32.1 
 
 
276 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  25.66 
 
 
735 aa  48.9  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  35.21 
 
 
733 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3155  cyclic nucleotide-binding protein  35.8 
 
 
599 aa  48.9  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  23.01 
 
 
363 aa  48.5  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  43.14 
 
 
256 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  21.78 
 
 
293 aa  48.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  22.47 
 
 
923 aa  48.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1449  Patatin  37.88 
 
 
361 aa  47.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  22.13 
 
 
323 aa  47.4  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  41.07 
 
 
584 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  41.18 
 
 
583 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  32.39 
 
 
1065 aa  47  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  21.82 
 
 
320 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  24.6 
 
 
746 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1162  Patatin  40.32 
 
 
254 aa  47  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.02065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  36.36 
 
 
252 aa  47.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  20.63 
 
 
275 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1912  patatin  22.73 
 
 
282 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>