More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2345 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  100 
 
 		 294 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  71.09 
 
 		 293 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  39 
 
 		 321 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  39 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  39 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  39 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  39 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  39 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  39 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  39 
 
 		 321 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  38.67 
 
 		 321 aa  211  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1855  patatin  39 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12074  transmembrane protein  35.08 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2007  Patatin  35.96 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  32.81 
 
 		 341 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  33.33 
 
 		 343 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1228  Patatin  32.21 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1449  Patatin  28.41 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  26.84 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  27.51 
 
 		 520 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1382  patatin  28.45 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01322  Patatin  29.83 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0310  hypothetical protein  25.43 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.544129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0660  Patatin  25.23 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.78646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1912  patatin  26.26 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  34.8 
 
 		 363 aa  94.4  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  28.69 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  24.82 
 
 		 740 aa  88.6  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  26.59 
 
 		 740 aa  87.4  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  28.69 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  28.33 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  28.28 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3042  patatin  32.14 
 
 		 586 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  28.28 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  28.28 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  27.92 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  29.11 
 
 		 357 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  26.4 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  26.4 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0115  patatin  26.39 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0045028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  27.87 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  26.97 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  25.8 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  25.61 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  29.32 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  29.32 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  23.08 
 
 		 737 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0819  alpha-beta hydrolase superfamily esterase  24.33 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  28.8 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  28.8 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  28.8 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  24.66 
 
 		 728 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  27.76 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  24.66 
 
 		 728 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  26.67 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  24.4 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  28.12 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  24.82 
 
 		 728 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  26.74 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  24.22 
 
 		 738 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1690  Patatin  26.61 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  22.92 
 
 		 754 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  24.49 
 
 		 727 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  24.65 
 
 		 751 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  27.5 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  23.53 
 
 		 760 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1205  patatin  26.28 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  29.72 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  32.11 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  32.64 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  29.32 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  27.18 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2479  hypothetical protein  21.64 
 
 		 661 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  29.32 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  28.27 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2334  hypothetical protein  21.6 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  24.91 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  27.18 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  26.05 
 
 		 775 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  29.47 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3038  putative exported phospholipase, patatin-like  28.33 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000229451  unclonable  0.00000199426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  28.21 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  26.7 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  29.91 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  25.42 
 
 		 720 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  24.67 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  26.38 
 
 		 746 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  26.81 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  25.58 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  25.55 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  23.08 
 
 		 796 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  28.71 
 
 		 728 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  23.36 
 
 		 803 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  24.91 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  23.36 
 
 		 803 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  23.08 
 
 		 798 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  23.36 
 
 		 803 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  23.36 
 
 		 804 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  27.94 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  28.74 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>