111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1228 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1228  Patatin  100 
 
 		 332 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  48.53 
 
 		 341 aa  268  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  40.64 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2007  Patatin  44.65 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12074  transmembrane protein  42.38 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  31.52 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  31.52 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  31.52 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  31.52 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  31.52 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  31.21 
 
 		 321 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  30.91 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  31.5 
 
 		 321 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  31.5 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  33.54 
 
 		 294 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  35.44 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1855  patatin  31.19 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  26.29 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1449  Patatin  27.37 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1382  patatin  30.67 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4240  patatin  28.09 
 
 		 540 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.579844  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  29.53 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0660  Patatin  28.02 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.78646 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3042  patatin  29.63 
 
 		 586 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  28.7 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  27.14 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0819  alpha-beta hydrolase superfamily esterase  30.43 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  33.82 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  26.19 
 
 		 740 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  27.15 
 
 		 798 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  27.15 
 
 		 796 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  25.5 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  27.23 
 
 		 746 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  31.05 
 
 		 803 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  31.05 
 
 		 803 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  31.05 
 
 		 803 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  30.22 
 
 		 813 aa  52.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  27.86 
 
 		 804 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  26.83 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2024  patatin  42.68 
 
 		 631 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103399 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  29.06 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  26.6 
 
 		 263 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5875  Patatin  34.81 
 
 		 646 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  26.54 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  26.44 
 
 		 303 aa  49.7  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  22.88 
 
 		 520 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  26.54 
 
 		 263 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  28.97 
 
 		 323 aa  49.7  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  26.32 
 
 		 894 aa  49.7  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  28.37 
 
 		 323 aa  49.3  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  28.44 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1065 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  28.38 
 
 		 754 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  25.59 
 
 		 267 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  25.62 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  25.59 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1844  patatin-like protein of phospholipase family protein  27.48 
 
 		 291 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.164556 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  27.19 
 
 		 753 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  31.22 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4103  patatin  37.66 
 
 		 685 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000427908 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  25.59 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  25.36 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  26.67 
 
 		 251 aa  47  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  25.59 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2479  hypothetical protein  21.1 
 
 		 661 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2334  hypothetical protein  35.21 
 
 		 665 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  27.96 
 
 		 293 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3155  cyclic nucleotide-binding protein  29.61 
 
 		 599 aa  46.2  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  25.59 
 
 		 263 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  25.59 
 
 		 263 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  25.59 
 
 		 263 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  26.07 
 
 		 330 aa  46.2  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  25.59 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1235  hypothetical protein  50.94 
 
 		 579 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  24.39 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0286  patatin  27.04 
 
 		 536 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  25.1 
 
 		 720 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  29.22 
 
 		 667 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  26.71 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  25.62 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1381  hypothetical protein  27.65 
 
 		 883 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1377  hypothetical protein  27.65 
 
 		 883 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  28.25 
 
 		 920 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  26.71 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  28.25 
 
 		 930 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  25 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0216  Patatin  28.95 
 
 		 624 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01322  Patatin  23.47 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  26.71 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  28.25 
 
 		 933 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1235  hypothetical protein  50.94 
 
 		 579 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  28.25 
 
 		 945 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  24.89 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1205  patatin  22.15 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  27.59 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  28.25 
 
 		 728 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  27.67 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1022  patatin-like phospholipase family protein  26.64 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.128561  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  27.91 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  23.56 
 
 		 275 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>