72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2542 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2542  patatin  100 
 
 		 326 aa  674    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  29.71 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  29.3 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  31.56 
 
 		 333 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  33.07 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  34.7 
 
 		 354 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  32.17 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  32.17 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  32.17 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  29.05 
 
 		 367 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  31.2 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  33.94 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  32.92 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  29.33 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  30.04 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  33.94 
 
 		 344 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  26.25 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  26.58 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  31.89 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  29.81 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  33.99 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  27.45 
 
 		 324 aa  99.8  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  25.08 
 
 		 320 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  27.76 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  29.91 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  27.25 
 
 		 332 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  27.25 
 
 		 332 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  27.25 
 
 		 332 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  27.25 
 
 		 332 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  27.25 
 
 		 332 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  27.25 
 
 		 375 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  27.59 
 
 		 397 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  25.95 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  30.83 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  30.83 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  28.87 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  29.57 
 
 		 390 aa  92.8  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  28.68 
 
 		 336 aa  92.8  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  30.42 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  26.81 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  29.01 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  36.67 
 
 		 382 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  27.8 
 
 		 340 aa  85.9  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  29.78 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  24.62 
 
 		 686 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1002 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  29.07 
 
 		 554 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  24.07 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  23.78 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  23.05 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  26.48 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  28.24 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  24.49 
 
 		 714 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  27.22 
 
 		 1678 aa  59.3  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  24.91 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  27.4 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1012  patatin  28.46 
 
 		 328 aa  57  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1228  Patatin  27.8 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  33.63 
 
 		 2272 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  26.73 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  27.23 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  26.73 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  26.73 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  26.73 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  26.73 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  26.73 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  26.73 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  27.14 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  29.65 
 
 		 241 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  24.3 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  23.5 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  25.13 
 
 		 247 aa  42.7  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>