254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1879 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  699    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  40.5 
 
 		 357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0660  Patatin  36.39 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.78646 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0819  alpha-beta hydrolase superfamily esterase  37.23 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3042  patatin  43.56 
 
 		 586 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  31.69 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  29.23 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  26.84 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  30 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  29.82 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  29.82 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  29.82 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  29.82 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  29.82 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  29.71 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  28.49 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  28.61 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  29.71 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2334  hypothetical protein  26.94 
 
 		 665 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2479  hypothetical protein  27.62 
 
 		 661 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01322  Patatin  24.45 
 
 		 296 aa  95.9  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12074  transmembrane protein  27.09 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1855  patatin  30.59 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  25.56 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1228  Patatin  26.29 
 
 		 332 aa  85.9  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2007  Patatin  28.17 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1205  patatin  25.08 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0115  patatin  22.09 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0045028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  24.16 
 
 		 520 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1381  hypothetical protein  30.39 
 
 		 883 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  29.7 
 
 		 728 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1377  hypothetical protein  29.65 
 
 		 883 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  31.82 
 
 		 720 aa  76.6  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  26.33 
 
 		 751 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  26.33 
 
 		 728 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  28.91 
 
 		 728 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  25.9 
 
 		 728 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2888  hypothetical protein  23.19 
 
 		 615 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  26.33 
 
 		 727 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1449  Patatin  24.43 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  30.53 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  29.06 
 
 		 728 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1912  patatin  20.86 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  29.32 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  28.95 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  27.57 
 
 		 875 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  29.7 
 
 		 760 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  28.36 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  28.26 
 
 		 280 aa  67  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  31.84 
 
 		 748 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0310  hypothetical protein  20.86 
 
 		 284 aa  67  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.544129  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  28.04 
 
 		 311 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  25.09 
 
 		 733 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  27.63 
 
 		 251 aa  67  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1235  hypothetical protein  40 
 
 		 579 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  27.89 
 
 		 275 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1235  hypothetical protein  38.82 
 
 		 579 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  28.19 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  28.57 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  27.72 
 
 		 738 aa  63.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  24.34 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  28.88 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  28.22 
 
 		 734 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  25 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  28.5 
 
 		 735 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  25.46 
 
 		 775 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  26.98 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  26.32 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  30.2 
 
 		 737 aa  60.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  27.75 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  28.08 
 
 		 738 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  28.08 
 
 		 738 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  26.98 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  28.57 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  27.8 
 
 		 740 aa  60.8  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  29.15 
 
 		 740 aa  60.5  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  26.18 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0062  hypothetical protein  28.77 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.968802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  27.57 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  27.44 
 
 		 923 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  27.8 
 
 		 738 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  28.64 
 
 		 798 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  28.64 
 
 		 796 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  26.34 
 
 		 777 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  27.8 
 
 		 738 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  26.98 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  24.51 
 
 		 736 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  27.8 
 
 		 737 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  24.87 
 
 		 308 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  24.87 
 
 		 621 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  28.87 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  27.8 
 
 		 738 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  26.29 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3038  putative exported phospholipase, patatin-like  23.62 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000229451  unclonable  0.00000199426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  28.08 
 
 		 750 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  28.23 
 
 		 738 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  28.04 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  25 
 
 		 790 aa  57  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  46.48 
 
 		 751 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  29 
 
 		 804 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>