150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2888 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2888  hypothetical protein  100 
 
 
615 aa  1267    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2479  hypothetical protein  24.68 
 
 
661 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2334  hypothetical protein  27.55 
 
 
665 aa  75.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  23.19 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1235  hypothetical protein  24.68 
 
 
579 aa  72.8  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51530  ExoU  44.44 
 
 
687 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167383  hitchhiker  0.000105618 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1235  hypothetical protein  40.85 
 
 
579 aa  66.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  40 
 
 
363 aa  65.5  0.000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6376  patatin  27.34 
 
 
444 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.103764  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  22.28 
 
 
294 aa  60.8  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  23.85 
 
 
740 aa  60.1  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  27.82 
 
 
520 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  46.55 
 
 
252 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  50 
 
 
581 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  23.37 
 
 
727 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  34.67 
 
 
357 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  39.73 
 
 
746 aa  53.9  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  48.21 
 
 
583 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  38.55 
 
 
748 aa  53.9  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  22.87 
 
 
751 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  35.53 
 
 
728 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  35.21 
 
 
321 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  38.46 
 
 
321 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3155  cyclic nucleotide-binding protein  54.9 
 
 
599 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  22.68 
 
 
728 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  23.22 
 
 
728 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  38.46 
 
 
321 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  38.46 
 
 
321 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  38.46 
 
 
321 aa  52  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  38.46 
 
 
321 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  38.46 
 
 
321 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  38.46 
 
 
321 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  38.46 
 
 
321 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  38.81 
 
 
263 aa  52  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2305  patatin  30.47 
 
 
348 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029553 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  40 
 
 
303 aa  51.2  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  37.35 
 
 
302 aa  51.6  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2456  patatin  36.17 
 
 
336 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2071  Patatin  34.25 
 
 
325 aa  51.6  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157936  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0660  Patatin  34.29 
 
 
321 aa  51.2  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.78646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1907  patatin  29.69 
 
 
346 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331125  hitchhiker  0.00000758802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3464  patatin  30.47 
 
 
346 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102358 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  36.14 
 
 
474 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0819  alpha-beta hydrolase superfamily esterase  26.24 
 
 
339 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  36.14 
 
 
349 aa  50.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  38.03 
 
 
733 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1747  patatin  29.69 
 
 
346 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  36.14 
 
 
358 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  36.14 
 
 
302 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43300  hypothetical protein  29.13 
 
 
345 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.882188  normal  0.835077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1570  patatin  35.48 
 
 
360 aa  50.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  23.08 
 
 
775 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  36.14 
 
 
347 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  36.14 
 
 
347 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3633  hypothetical protein  29.13 
 
 
345 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  42.25 
 
 
256 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  34.94 
 
 
306 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  36.14 
 
 
306 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  34.94 
 
 
308 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  34.94 
 
 
305 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  34.94 
 
 
305 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  34.41 
 
 
301 aa  49.3  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  41.67 
 
 
377 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2126  patatin  36.47 
 
 
304 aa  49.7  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  hitchhiker  0.00774444 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1162  Patatin  45.76 
 
 
254 aa  49.3  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.02065  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  41.67 
 
 
377 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  41.67 
 
 
253 aa  48.9  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  29.13 
 
 
345 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  34.88 
 
 
741 aa  48.9  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  36.14 
 
 
347 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  37.31 
 
 
583 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  39.71 
 
 
293 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  39.13 
 
 
308 aa  48.5  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  31.71 
 
 
735 aa  48.1  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  36.99 
 
 
311 aa  47.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  36.99 
 
 
316 aa  48.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  39.34 
 
 
375 aa  48.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  35.82 
 
 
777 aa  47.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.37 
 
 
748 aa  47.8  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3042  patatin  30.14 
 
 
586 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  34.62 
 
 
760 aa  47.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12074  transmembrane protein  33.77 
 
 
324 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  36.76 
 
 
272 aa  47.8  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.08 
 
 
263 aa  47.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  38.33 
 
 
621 aa  47.4  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.33 
 
 
624 aa  47.4  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2995  patatin  35.71 
 
 
326 aa  47.4  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  36.51 
 
 
720 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  33.73 
 
 
358 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  40.85 
 
 
334 aa  47  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  39.47 
 
 
737 aa  47  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  47.37 
 
 
335 aa  47  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  34.92 
 
 
738 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  42.37 
 
 
751 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  33.73 
 
 
348 aa  47  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_006686  CND04180  hydrolase, putative  44.23 
 
 
1588 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  38.1 
 
 
293 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  36.51 
 
 
738 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  36.51 
 
 
738 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  36.36 
 
 
734 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>