276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12074 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12074  transmembrane protein  100 
 
 
324 aa  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2007  Patatin  48.56 
 
 
323 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  44.62 
 
 
341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  43.41 
 
 
343 aa  224  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  39.17 
 
 
321 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  38.85 
 
 
321 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  39.17 
 
 
321 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  39.17 
 
 
321 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  39.17 
 
 
321 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  39.17 
 
 
321 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  39.17 
 
 
321 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  38.54 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  38.54 
 
 
321 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1228  Patatin  42.38 
 
 
332 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1855  patatin  37.9 
 
 
321 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  35.08 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  37.05 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1449  Patatin  29.38 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  28.24 
 
 
339 aa  105  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  26.78 
 
 
520 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1382  patatin  24.57 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  21.7 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  34.3 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  29.81 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  32.55 
 
 
767 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  33.17 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  30.84 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4240  patatin  27.5 
 
 
540 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.579844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  30.65 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01322  Patatin  26.91 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2071  Patatin  28.24 
 
 
325 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157936  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1377  hypothetical protein  26.22 
 
 
883 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3038  putative exported phospholipase, patatin-like  27.04 
 
 
274 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000229451  unclonable  0.00000199426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1205  patatin  26.51 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0660  Patatin  23.49 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.78646 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  29.44 
 
 
720 aa  62.8  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1381  hypothetical protein  25.91 
 
 
883 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3042  patatin  29.63 
 
 
586 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  30.61 
 
 
247 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0310  hypothetical protein  25.33 
 
 
284 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.544129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1912  patatin  21.73 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  28.57 
 
 
804 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  30.36 
 
 
728 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2479  hypothetical protein  24.12 
 
 
661 aa  59.7  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  28.51 
 
 
798 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2334  hypothetical protein  24.12 
 
 
665 aa  59.3  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  28.31 
 
 
796 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  28.57 
 
 
803 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  31.47 
 
 
398 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  31.79 
 
 
241 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  28.57 
 
 
803 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  28.57 
 
 
803 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  30.09 
 
 
291 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2469  patatin  26.63 
 
 
347 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.504238  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  25.49 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  29 
 
 
303 aa  57.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  28.96 
 
 
223 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  21.76 
 
 
250 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  25.1 
 
 
351 aa  57  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  26.26 
 
 
736 aa  57.4  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  29.47 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  28.12 
 
 
358 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  29.82 
 
 
728 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  29.82 
 
 
751 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  27.83 
 
 
746 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  30.36 
 
 
399 aa  57  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  28.89 
 
 
727 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  26.43 
 
 
293 aa  56.6  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  27.48 
 
 
358 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  29.36 
 
 
728 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  25.1 
 
 
302 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  28.36 
 
 
263 aa  56.2  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  29.09 
 
 
875 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  24.27 
 
 
740 aa  56.2  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  24.89 
 
 
894 aa  55.8  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  26.6 
 
 
272 aa  55.8  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  27.56 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  27.03 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  24.67 
 
 
775 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  30.43 
 
 
728 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  26.67 
 
 
251 aa  55.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  29.68 
 
 
728 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  30.39 
 
 
323 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  26.48 
 
 
813 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  27.03 
 
 
347 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  27.1 
 
 
735 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  29.33 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  27.03 
 
 
347 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  27.4 
 
 
474 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  26.51 
 
 
751 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  25.43 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  25.43 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1844  patatin-like protein of phospholipase family protein  23.72 
 
 
291 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.164556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  25.43 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  21.92 
 
 
760 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  25.43 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  25.93 
 
 
739 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  26.58 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  26.61 
 
 
950 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1747  patatin  27.94 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>