More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3038 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3038  putative exported phospholipase, patatin-like  100 
 
 
274 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000229451  unclonable  0.00000199426 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01322  Patatin  29.34 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1205  patatin  30.43 
 
 
279 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  25.99 
 
 
321 aa  99  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  25.99 
 
 
321 aa  99  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  25.99 
 
 
321 aa  99  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  25.99 
 
 
321 aa  99  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  25.99 
 
 
321 aa  99  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  38.46 
 
 
306 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  38.46 
 
 
347 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  38.46 
 
 
347 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  25.66 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  38.46 
 
 
474 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  37.87 
 
 
347 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  37.87 
 
 
358 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  25.66 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  36.09 
 
 
305 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  36.09 
 
 
306 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  36.69 
 
 
302 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  36.09 
 
 
305 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  36.69 
 
 
308 aa  95.9  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  36.69 
 
 
302 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  36.09 
 
 
358 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  33.68 
 
 
349 aa  92.8  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  34.91 
 
 
315 aa  92.4  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  32.49 
 
 
318 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  37.66 
 
 
347 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  37.66 
 
 
347 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  34.32 
 
 
317 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  32.49 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  35.09 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  29.65 
 
 
728 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  30.15 
 
 
728 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  34.91 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0062  hypothetical protein  32.37 
 
 
286 aa  86.3  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.968802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0310  hypothetical protein  32.88 
 
 
284 aa  85.9  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.544129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  23.68 
 
 
321 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  29.58 
 
 
728 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  33.73 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  23.36 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  29.19 
 
 
727 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  34.05 
 
 
324 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  30.93 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  28.71 
 
 
728 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  28.71 
 
 
751 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  34.66 
 
 
280 aa  82.4  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  28.71 
 
 
728 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1912  patatin  23.51 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0115  patatin  34.29 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0045028  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1726  patatin  31.58 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0620011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  32.04 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  30 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  29.65 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  26.97 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  23.08 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  28.97 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  30.18 
 
 
320 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  29.34 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  32.54 
 
 
335 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  32.92 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  28.23 
 
 
733 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  31.17 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  28.57 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  31.14 
 
 
327 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  30.41 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  31.14 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2126  patatin  29.9 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  hitchhiker  0.00774444 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  33.33 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  30.96 
 
 
748 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  27.98 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  28.33 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  27.38 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  31.37 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  32.6 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  30.05 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  27.91 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  31.71 
 
 
262 aa  72  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  29.52 
 
 
320 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  29.52 
 
 
320 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  28.57 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  30.6 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  29.52 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  30.65 
 
 
267 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  28.02 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  28.24 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  30.49 
 
 
813 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  26.79 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  26.79 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  32.74 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  26.79 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  30.36 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  27.24 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  25.58 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  26.79 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  25.82 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  26.79 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  26.79 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  26.79 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  28.06 
 
 
738 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  28.71 
 
 
735 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>