More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1726 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1726  patatin  100 
 
 		 311 aa  624  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0620011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  37.8 
 
 		 287 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  36.22 
 
 		 335 aa  175  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  38.01 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  35.15 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  34.81 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  35.15 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2340  alpha-beta hydrolase family esterase  36.79 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  35.15 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  34.81 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  35.15 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  35.74 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  34.81 
 
 		 263 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  34.81 
 
 		 263 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  34.81 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  34.47 
 
 		 263 aa  165  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  37.17 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  35.6 
 
 		 354 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  36.09 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  34.94 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  47.62 
 
 		 273 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  34.42 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  34.62 
 
 		 345 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  32.07 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  36.61 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  41.81 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  41.24 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  36.42 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  41.81 
 
 		 275 aa  152  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  36.3 
 
 		 320 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  34.65 
 
 		 343 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  33.66 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  29.87 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  41.92 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  34.67 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  32.99 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  33.89 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  32.46 
 
 		 347 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  34.45 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  35.06 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  30.94 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  34.42 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  29.77 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  32.67 
 
 		 348 aa  143  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  38.43 
 
 		 741 aa  143  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  29.08 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  39.64 
 
 		 733 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  46.93 
 
 		 351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  40 
 
 		 796 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  37.61 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  37.61 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  37.61 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  39.22 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  39.5 
 
 		 803 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  33.58 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  39.5 
 
 		 803 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  39.5 
 
 		 803 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  40.47 
 
 		 767 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  40.93 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  33.23 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3119  Patatin  44.75 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  39.57 
 
 		 798 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  33.56 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  40.93 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  31.31 
 
 		 751 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  36.78 
 
 		 727 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  37.39 
 
 		 667 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  31.31 
 
 		 728 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  40.93 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  37.67 
 
 		 728 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  37.04 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  38.7 
 
 		 813 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  37.5 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  38.14 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  38.14 
 
 		 347 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  41.4 
 
 		 474 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  39.57 
 
 		 804 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  38.14 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  30 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  42.46 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2204  hypothetical protein  35.71 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  37.56 
 
 		 728 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  36.57 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.79 
 
 		 760 aa  133  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  37.67 
 
 		 347 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  34.85 
 
 		 748 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  27.97 
 
 		 301 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  29.26 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  31.09 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  37.24 
 
 		 728 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  31.49 
 
 		 304 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  37.27 
 
 		 746 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  37.24 
 
 		 933 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  37.24 
 
 		 920 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  40.36 
 
 		 728 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  37.24 
 
 		 945 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  37.24 
 
 		 930 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  39.29 
 
 		 346 aa  132  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  30.74 
 
 		 322 aa  132  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  27.65 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>