286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0310 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0310  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  585  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.544129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0115  patatin  64.26 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0045028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1912  patatin  48.72 
 
 		 282 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1205  patatin  31.8 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01322  Patatin  31.06 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  25.43 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  29.45 
 
 		 321 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  29.45 
 
 		 321 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  29.45 
 
 		 321 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  29.45 
 
 		 321 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  29.45 
 
 		 321 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  29.45 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  29.11 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  30.47 
 
 		 318 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  30.47 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  37.35 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  34.78 
 
 		 319 aa  86.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  30.69 
 
 		 308 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3038  putative exported phospholipase, patatin-like  32.88 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000229451  unclonable  0.00000199426 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  32.04 
 
 		 301 aa  85.5  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  30.16 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  25 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  30.69 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  30.69 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  30.69 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  29.63 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  29.17 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  29.08 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  29.08 
 
 		 474 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  31.07 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  29.44 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  29.74 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  29.08 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  29.45 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  29.51 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  30.69 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  34.24 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  31.32 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  29.02 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  36.08 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  32.61 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  31.69 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  32.61 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  29.39 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  31.15 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.07 
 
 		 343 aa  75.5  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  34.88 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  32.45 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  32.45 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  24.93 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  31.44 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  29.58 
 
 		 767 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  29.94 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  28.57 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  28.57 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  29.38 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  29.74 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  32.85 
 
 		 707 aa  69.7  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  30.99 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  30.05 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0062  hypothetical protein  32.35 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.968802  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  29.29 
 
 		 720 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  31.02 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  26.23 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  29.59 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  20.86 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  23.35 
 
 		 520 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  29.57 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  48.75 
 
 		 728 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  30.6 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  28.64 
 
 		 748 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1022  patatin-like phospholipase family protein  35.95 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.128561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  24.71 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  30.62 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  31.61 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  30.62 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  28.36 
 
 		 728 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  28.65 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  27.7 
 
 		 796 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  28.99 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  27.7 
 
 		 798 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  29.41 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  30.48 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  26.89 
 
 		 813 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  31.19 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10170  FabD/lysophospholipase-like protein  32.78 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280701  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  29.82 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  29.38 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  25.32 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  26.67 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  28.36 
 
 		 728 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  32.63 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  29.94 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  29.5 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  29.59 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  30 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  29.57 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  25.94 
 
 		 803 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  25.94 
 
 		 803 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  25.94 
 
 		 803 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>