173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2007 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2007  Patatin  100 
 
 		 323 aa  635    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12074  transmembrane protein  48.56 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1228  Patatin  44.16 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  43.63 
 
 		 343 aa  203  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  40.31 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  34.71 
 
 		 321 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  34.71 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  34.71 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  34.71 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  34.71 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  34.71 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  34.71 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  35.96 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  34.84 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  34.84 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  35.71 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1855  patatin  35.35 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1449  Patatin  28.07 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1382  patatin  29.26 
 
 		 374 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  27.98 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  30.67 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  24.86 
 
 		 520 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  28.9 
 
 		 740 aa  73.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  28.5 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  33.65 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4240  patatin  29.32 
 
 		 540 aa  70.1  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.579844  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0488  patatin  27.92 
 
 		 313 aa  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268881  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1844  patatin-like protein of phospholipase family protein  29.38 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.164556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0660  Patatin  24.14 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.78646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01322  Patatin  26.13 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  28.37 
 
 		 746 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  29.09 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  33.48 
 
 		 667 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  30.26 
 
 		 767 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  26.22 
 
 		 775 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  26.63 
 
 		 720 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  29.86 
 
 		 803 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  29.86 
 
 		 803 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  29.86 
 
 		 803 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2826  patatin-like phospholipase family protein  26.64 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.801002  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  25.68 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  26.77 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  30.49 
 
 		 707 aa  57  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  29.41 
 
 		 796 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  27.52 
 
 		 760 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  29.41 
 
 		 798 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  27.51 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2456  patatin  29.38 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3633  hypothetical protein  27.49 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43300  hypothetical protein  27.49 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.882188  normal  0.835077 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  26.77 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  26.77 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  26.77 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  26.77 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  28.67 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1205  patatin  24.52 
 
 		 279 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  29.07 
 
 		 728 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  28.96 
 
 		 804 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  25.85 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  27.04 
 
 		 875 aa  53.9  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  26.79 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  30.37 
 
 		 813 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  28.3 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  27.53 
 
 		 247 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  30 
 
 		 753 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  22.6 
 
 		 250 aa  53.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  28.57 
 
 		 728 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  28.29 
 
 		 275 aa  53.1  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  28.85 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  30.1 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  41.56 
 
 		 740 aa  53.1  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  28.57 
 
 		 751 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  28.57 
 
 		 728 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  28.99 
 
 		 252 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  27.75 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  24.91 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  24.91 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  24.91 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  27.05 
 
 		 330 aa  52.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1747  patatin  24.77 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  26.03 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3038  putative exported phospholipase, patatin-like  26.21 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000229451  unclonable  0.00000199426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  29.02 
 
 		 728 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  29.13 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  27.55 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  27.92 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  28.25 
 
 		 728 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2995  patatin  27.7 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  28.12 
 
 		 727 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3464  patatin  24.77 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  27.48 
 
 		 583 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0310  hypothetical protein  27.4 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.544129  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  27.75 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  25.84 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  27.55 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  27.27 
 
 		 981 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  27.75 
 
 		 346 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  27.72 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  28.71 
 
 		 348 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  27.4 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>