141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1449 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1449  Patatin  100 
 
 		 361 aa  736    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1382  patatin  44.84 
 
 		 374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  28.49 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  28.41 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  27.65 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  27.37 
 
 		 321 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  27.37 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  27.37 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  27.37 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  27.37 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  27.37 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  25.88 
 
 		 343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  27.09 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  27.37 
 
 		 321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  25.73 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12074  transmembrane protein  28.53 
 
 		 324 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2007  Patatin  28.07 
 
 		 323 aa  99.4  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1855  patatin  27.15 
 
 		 321 aa  99.4  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1228  Patatin  35.88 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  24.43 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  24.41 
 
 		 740 aa  67.8  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  26.88 
 
 		 740 aa  67.8  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  25.87 
 
 		 520 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  22.7 
 
 		 803 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  22.7 
 
 		 803 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  22.7 
 
 		 803 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  26.14 
 
 		 707 aa  64.7  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  22.94 
 
 		 950 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  24.57 
 
 		 746 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  26.85 
 
 		 728 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  25.68 
 
 		 728 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  22.02 
 
 		 804 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  23.99 
 
 		 790 aa  60.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  22.09 
 
 		 798 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  22.09 
 
 		 796 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  21.92 
 
 		 920 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  21.58 
 
 		 930 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  21.5 
 
 		 933 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  21.5 
 
 		 945 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  21.5 
 
 		 728 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  25.97 
 
 		 728 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  26.02 
 
 		 738 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  22.94 
 
 		 875 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  21.92 
 
 		 852 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  25.56 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  22.77 
 
 		 767 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  24.16 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  24.33 
 
 		 760 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  21.45 
 
 		 714 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4240  patatin  30.16 
 
 		 540 aa  56.6  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.579844  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  24.9 
 
 		 751 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  26.27 
 
 		 728 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  26.27 
 
 		 728 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  26.27 
 
 		 727 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  25.58 
 
 		 775 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  23.53 
 
 		 741 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  22.05 
 
 		 813 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  23.05 
 
 		 735 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1235  hypothetical protein  24.84 
 
 		 579 aa  53.1  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1381  hypothetical protein  25.1 
 
 		 883 aa  53.1  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  24.54 
 
 		 736 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  23.49 
 
 		 754 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  23.3 
 
 		 923 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  26.57 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  24.54 
 
 		 751 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1235  hypothetical protein  25.64 
 
 		 579 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1377  hypothetical protein  24.71 
 
 		 883 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  23.74 
 
 		 737 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1690  Patatin  30.4 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  23.99 
 
 		 739 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  23.37 
 
 		 894 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0310  hypothetical protein  22.38 
 
 		 284 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.544129  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  24.66 
 
 		 735 aa  50.4  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  24.16 
 
 		 667 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  23.05 
 
 		 720 aa  49.7  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0660  Patatin  23.02 
 
 		 321 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.78646 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3042  patatin  25.09 
 
 		 586 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  40 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  30.77 
 
 		 981 aa  48.9  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  23.99 
 
 		 738 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  23.99 
 
 		 738 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  34.25 
 
 		 900 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  39.06 
 
 		 909 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  23.63 
 
 		 737 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2479  hypothetical protein  37.88 
 
 		 661 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2334  hypothetical protein  37.88 
 
 		 665 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0819  alpha-beta hydrolase superfamily esterase  21.73 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  22.79 
 
 		 753 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1162  Patatin  33.8 
 
 		 254 aa  47.4  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.02065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  25.62 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01322  Patatin  24.05 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  22.14 
 
 		 734 aa  47  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  21.58 
 
 		 733 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  26 
 
 		 340 aa  47  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  23.74 
 
 		 737 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  31.51 
 
 		 275 aa  46.2  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  35.14 
 
 		 263 aa  46.2  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  23.16 
 
 		 748 aa  46.2  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  23.74 
 
 		 738 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  23.74 
 
 		 738 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>