127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1235 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1235  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1203    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1235  hypothetical protein  95.85 
 
 
579 aa  1158    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51530  ExoU  27.52 
 
 
687 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167383  hitchhiker  0.000105618 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2334  hypothetical protein  25.61 
 
 
665 aa  72  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2479  hypothetical protein  25.26 
 
 
661 aa  70.5  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2888  hypothetical protein  40.85 
 
 
615 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  38.82 
 
 
339 aa  65.1  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0660  Patatin  50 
 
 
321 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.78646 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  51.02 
 
 
357 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  24.83 
 
 
520 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  37.65 
 
 
707 aa  61.2  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3042  patatin  44.64 
 
 
586 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  50 
 
 
363 aa  57.8  0.0000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  35 
 
 
247 aa  56.2  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  31.51 
 
 
321 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  32.71 
 
 
253 aa  53.9  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  32.88 
 
 
321 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  47.27 
 
 
740 aa  53.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1449  Patatin  24.84 
 
 
361 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  50 
 
 
321 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  50 
 
 
321 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  50 
 
 
321 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  50 
 
 
321 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  36.59 
 
 
740 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  50 
 
 
321 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  50 
 
 
321 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  50 
 
 
321 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1377  hypothetical protein  25.59 
 
 
883 aa  52.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  39.76 
 
 
317 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1381  hypothetical protein  25.59 
 
 
883 aa  51.2  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  41.07 
 
 
283 aa  51.2  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0819  alpha-beta hydrolase superfamily esterase  39.53 
 
 
339 aa  51.2  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  33.65 
 
 
343 aa  50.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  35.21 
 
 
294 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  40.32 
 
 
293 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  43.1 
 
 
312 aa  50.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  38.03 
 
 
293 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  55.26 
 
 
314 aa  50.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  24.52 
 
 
741 aa  49.7  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  48.39 
 
 
313 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  42.11 
 
 
251 aa  49.7  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6376  patatin  50 
 
 
444 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.103764  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  48.15 
 
 
330 aa  49.3  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  34.62 
 
 
751 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  43.4 
 
 
728 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  42.19 
 
 
241 aa  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  43.4 
 
 
728 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  35.29 
 
 
320 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  34.85 
 
 
259 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  40.32 
 
 
283 aa  47.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  30.49 
 
 
760 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  47.37 
 
 
311 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  35.29 
 
 
320 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  43.59 
 
 
333 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3119  Patatin  44.9 
 
 
324 aa  47.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  42.62 
 
 
729 aa  47.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  43.94 
 
 
347 aa  47.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  41.38 
 
 
303 aa  47.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
397 aa  47.4  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  33.33 
 
 
256 aa  47.4  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3038  putative exported phospholipase, patatin-like  39.58 
 
 
274 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000229451  unclonable  0.00000199426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  55.88 
 
 
318 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  30.1 
 
 
796 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  42.86 
 
 
748 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  41.67 
 
 
406 aa  46.6  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  41.51 
 
 
727 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  48.98 
 
 
405 aa  47  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  55.88 
 
 
318 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  31.87 
 
 
594 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
583 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  33 
 
 
303 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  41.82 
 
 
621 aa  46.2  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  32 
 
 
733 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  48.98 
 
 
349 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  32.93 
 
 
767 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  28.57 
 
 
803 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  41.67 
 
 
728 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  28.57 
 
 
803 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  48.08 
 
 
734 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  38.89 
 
 
394 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  45.45 
 
 
753 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  43.64 
 
 
728 aa  46.2  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  29.21 
 
 
775 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  38.89 
 
 
1048 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  41.67 
 
 
728 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  50 
 
 
320 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  34.21 
 
 
288 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3155  cyclic nucleotide-binding protein  48.98 
 
 
599 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  48.57 
 
 
735 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  28.57 
 
 
803 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  37.31 
 
 
302 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  40.32 
 
 
311 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  30.51 
 
 
288 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12074  transmembrane protein  43.86 
 
 
324 aa  45.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  48.57 
 
 
751 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  35.14 
 
 
581 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48799  predicted protein  27.63 
 
 
892 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  33.33 
 
 
398 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  36.21 
 
 
216 aa  45.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  33.33 
 
 
358 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>