72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48799 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48799  predicted protein  100 
 
 		 892 aa  1851    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41292  predicted protein  35.53 
 
 		 566 aa  231  7e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.278724  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01713  Patatin family phospholipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08440)  35.52 
 
 		 789 aa  194  7e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0885007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4077  predicted protein  32.4 
 
 		 434 aa  179  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0147505 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02340  lipid particle protein, putative  32.44 
 
 		 871 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00408  Patatin-like phospholipase domain-containing protein AN0408 (EC 3.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGC2]  30.69 
 
 		 749 aa  175  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0593529 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40606  predicted protein  30.61 
 
 		 844 aa  169  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.238629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01156  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily protein  31.43 
 
 		 486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45518  predicted protein  29.35 
 
 		 918 aa  156  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1588  patatin  30.75 
 
 		 495 aa  154  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_1971  predicted protein  30.71 
 
 		 492 aa  153  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57363  predicted protein  26.98 
 
 		 690 aa  150  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0196  patatin  28.03 
 
 		 482 aa  139  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59048  predicted protein  22.41 
 
 		 617 aa  73.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.717553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  26.17 
 
 		 813 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  26.03 
 
 		 852 aa  54.3  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  26.15 
 
 		 398 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  25.71 
 
 		 748 aa  53.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  25 
 
 		 714 aa  53.5  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  24.77 
 
 		 728 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  24.77 
 
 		 945 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  25.66 
 
 		 751 aa  52.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  24.77 
 
 		 933 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  23.61 
 
 		 804 aa  51.6  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  24.77 
 
 		 930 aa  52  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  24.77 
 
 		 920 aa  51.6  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  24.54 
 
 		 796 aa  51.6  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  24.23 
 
 		 311 aa  51.6  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  28.37 
 
 		 320 aa  51.6  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  24.54 
 
 		 798 aa  51.2  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  25.26 
 
 		 316 aa  51.2  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  25.23 
 
 		 318 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  23.14 
 
 		 760 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2182  patatin  51.02 
 
 		 293 aa  50.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  23.89 
 
 		 735 aa  49.7  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  24.38 
 
 		 319 aa  49.7  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  25.23 
 
 		 318 aa  50.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  24.07 
 
 		 803 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  24.07 
 
 		 803 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  23.28 
 
 		 256 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  24.07 
 
 		 803 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  25.81 
 
 		 336 aa  49.3  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  27.37 
 
 		 251 aa  49.7  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  22.58 
 
 		 252 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  27.51 
 
 		 310 aa  48.5  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  22.92 
 
 		 894 aa  48.1  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  26.59 
 
 		 394 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  22.61 
 
 		 256 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1574  hypothetical protein  25 
 
 		 301 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  25 
 
 		 301 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  25.23 
 
 		 767 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  25 
 
 		 301 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  25 
 
 		 301 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  25 
 
 		 301 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1791  patatin  26.11 
 
 		 386 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  24.09 
 
 		 667 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.21 
 
 		 597 aa  47.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  24.8 
 
 		 419 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  45.28 
 
 		 377 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  26.34 
 
 		 581 aa  45.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  43.4 
 
 		 377 aa  46.2  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1775  patatin  36.62 
 
 		 361 aa  45.4  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  40.35 
 
 		 775 aa  45.8  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  22.78 
 
 		 339 aa  45.8  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  34.62 
 
 		 753 aa  45.8  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1235  hypothetical protein  27.63 
 
 		 579 aa  45.4  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  43.55 
 
 		 378 aa  45.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  40.68 
 
 		 379 aa  45.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  26.89 
 
 		 371 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  22.27 
 
 		 250 aa  45.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  40.35 
 
 		 720 aa  44.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  23.32 
 
 		 707 aa  44.3  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>