122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_4077 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009370  OSTLU_4077  predicted protein  100 
 
 
434 aa  898    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0147505 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01713  Patatin family phospholipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08440)  35.11 
 
 
789 aa  262  8e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0885007  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40606  predicted protein  31.36 
 
 
844 aa  245  9e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.238629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01156  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily protein  33.48 
 
 
486 aa  229  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1588  patatin  32.43 
 
 
495 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_1971  predicted protein  32.4 
 
 
492 aa  211  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41292  predicted protein  30 
 
 
566 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.278724  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02340  lipid particle protein, putative  33.85 
 
 
871 aa  194  3e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0196  patatin  29.21 
 
 
482 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.931024 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00408  Patatin-like phospholipase domain-containing protein AN0408 (EC 3.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGC2]  31.16 
 
 
749 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0593529 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57363  predicted protein  28.17 
 
 
690 aa  167  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48799  predicted protein  32.4 
 
 
892 aa  162  9e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45518  predicted protein  33.06 
 
 
918 aa  158  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59048  predicted protein  28.93 
 
 
617 aa  148  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.717553 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  26.11 
 
 
263 aa  56.2  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  33.33 
 
 
276 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  25.59 
 
 
302 aa  54.3  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  20.98 
 
 
250 aa  53.5  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  26.86 
 
 
357 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  28.65 
 
 
760 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  32.58 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  24.39 
 
 
335 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  29.41 
 
 
277 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.83 
 
 
748 aa  50.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  25.91 
 
 
341 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  26.22 
 
 
327 aa  50.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  28.16 
 
 
301 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.94 
 
 
763 aa  50.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  29.52 
 
 
265 aa  50.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  24.53 
 
 
334 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  27.76 
 
 
301 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  39.71 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  27.76 
 
 
301 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  29.31 
 
 
312 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2182  patatin  25.41 
 
 
293 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  35.62 
 
 
400 aa  49.7  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  29.03 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4233  patatin  31.17 
 
 
245 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.94 
 
 
765 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  23.33 
 
 
256 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  29.03 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  38.64 
 
 
384 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  36.92 
 
 
417 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  37.7 
 
 
323 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  26.32 
 
 
304 aa  47  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  26.53 
 
 
314 aa  47  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  27.75 
 
 
707 aa  46.6  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  22.62 
 
 
251 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  33.33 
 
 
429 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  24.7 
 
 
345 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  25.17 
 
 
252 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  29.52 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  29.09 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  36.92 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  28.87 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3464  patatin  25.3 
 
 
346 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102358 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  23.79 
 
 
740 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  25.39 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  22.75 
 
 
346 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  22.75 
 
 
346 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  27.43 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  34.72 
 
 
371 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  22.69 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  34.72 
 
 
371 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  24.18 
 
 
324 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  22.41 
 
 
803 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  24.17 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  22.41 
 
 
803 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  26.59 
 
 
320 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  24.86 
 
 
740 aa  45.8  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  40.28 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  36.36 
 
 
386 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  22.41 
 
 
803 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  29.41 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  41.51 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  27.66 
 
 
399 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2305  patatin  24.7 
 
 
348 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029553 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  26.97 
 
 
410 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  41.07 
 
 
790 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  40 
 
 
378 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  25.23 
 
 
247 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  30.77 
 
 
317 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  27.71 
 
 
262 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  20.7 
 
 
263 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  28.21 
 
 
621 aa  44.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  21.99 
 
 
804 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  30.77 
 
 
317 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  38.81 
 
 
753 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  30.43 
 
 
341 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  20.7 
 
 
263 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  24.26 
 
 
300 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  25.24 
 
 
301 aa  44.3  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1377  hypothetical protein  28.49 
 
 
883 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  33.78 
 
 
379 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  32.86 
 
 
767 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1595  patatin  24.12 
 
 
310 aa  44.3  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.613745  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  34.12 
 
 
377 aa  43.9  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1381  hypothetical protein  28.49 
 
 
883 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  22.42 
 
 
796 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1747  patatin  24.1 
 
 
346 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400605 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>