79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45518 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45518  predicted protein  100 
 
 
918 aa  1909    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02340  lipid particle protein, putative  38.21 
 
 
871 aa  270  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00408  Patatin-like phospholipase domain-containing protein AN0408 (EC 3.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGC2]  38.92 
 
 
749 aa  254  5.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0593529 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57363  predicted protein  35.25 
 
 
690 aa  227  7e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41292  predicted protein  31.51 
 
 
566 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.278724  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1588  patatin  32.73 
 
 
495 aa  186  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40606  predicted protein  31.47 
 
 
844 aa  184  5.0000000000000004e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.238629 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_1971  predicted protein  32.06 
 
 
492 aa  176  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01713  Patatin family phospholipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08440)  31.69 
 
 
789 aa  171  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0885007  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4077  predicted protein  33.06 
 
 
434 aa  170  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0147505 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48799  predicted protein  29.35 
 
 
892 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0196  patatin  28.65 
 
 
482 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01156  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily protein  30.11 
 
 
486 aa  147  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59048  predicted protein  31.6 
 
 
617 aa  119  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.717553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  25.69 
 
 
256 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  35.4 
 
 
429 aa  54.3  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  40.26 
 
 
334 aa  53.5  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  31.09 
 
 
583 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  23.83 
 
 
250 aa  52.8  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  43.33 
 
 
343 aa  52  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  38.96 
 
 
339 aa  51.2  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  26.11 
 
 
323 aa  50.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  41.67 
 
 
317 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  38.46 
 
 
317 aa  50.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  23.58 
 
 
263 aa  49.7  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  50 
 
 
252 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  29.71 
 
 
581 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  28.74 
 
 
303 aa  49.7  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  33.33 
 
 
373 aa  49.3  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  26.15 
 
 
251 aa  48.9  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  27.78 
 
 
277 aa  48.9  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  35.62 
 
 
348 aa  48.5  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  31.48 
 
 
387 aa  48.5  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  27.78 
 
 
357 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  28.18 
 
 
324 aa  48.1  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  24.3 
 
 
247 aa  47.8  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  25.68 
 
 
323 aa  47.8  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  26.25 
 
 
322 aa  47.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  25.11 
 
 
323 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1398  phospholipase, patatin family  45.1 
 
 
352 aa  47.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.326586 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  23.58 
 
 
262 aa  47.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  43.14 
 
 
316 aa  47.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  38.24 
 
 
727 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  44.44 
 
 
375 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  44.44 
 
 
302 aa  46.6  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  38.6 
 
 
323 aa  47  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0344  patatin family phospholipase  47.06 
 
 
285 aa  47  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  25.74 
 
 
256 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  46.94 
 
 
410 aa  46.2  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  39.22 
 
 
346 aa  46.2  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  39.22 
 
 
346 aa  46.2  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1068  patatin family phospholipase  43.14 
 
 
356 aa  45.8  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0343802 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.55 
 
 
765 aa  45.8  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2849  phospholipase, patatin family  43.14 
 
 
352 aa  45.8  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.41074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  41.07 
 
 
300 aa  45.4  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  46.15 
 
 
333 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  35.29 
 
 
345 aa  45.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  40.35 
 
 
733 aa  45.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  31.55 
 
 
584 aa  45.4  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  40.74 
 
 
315 aa  45.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  28.71 
 
 
400 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  39.22 
 
 
330 aa  45.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  46.15 
 
 
320 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  46.15 
 
 
320 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  28.71 
 
 
400 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  45.28 
 
 
377 aa  45.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  41.67 
 
 
311 aa  45.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  35.63 
 
 
371 aa  45.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  33.64 
 
 
621 aa  45.1  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  28.74 
 
 
321 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  35.29 
 
 
390 aa  44.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  29.71 
 
 
294 aa  44.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  35.63 
 
 
371 aa  44.7  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  43.75 
 
 
728 aa  44.7  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  37.25 
 
 
345 aa  44.7  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  37.5 
 
 
346 aa  44.3  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.48 
 
 
624 aa  44.3  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  35.29 
 
 
347 aa  44.3  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  43.4 
 
 
377 aa  44.3  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>