221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01156 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01156  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily protein  100 
 
 
486 aa  1002    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1588  patatin  38.67 
 
 
495 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0196  patatin  36.82 
 
 
482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.931024 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01713  Patatin family phospholipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08440)  32.99 
 
 
789 aa  249  5e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0885007  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40606  predicted protein  32.39 
 
 
844 aa  247  4e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.238629 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4077  predicted protein  33.48 
 
 
434 aa  229  6e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0147505 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41292  predicted protein  30.72 
 
 
566 aa  224  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.278724  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00408  Patatin-like phospholipase domain-containing protein AN0408 (EC 3.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGC2]  31.02 
 
 
749 aa  213  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0593529 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57363  predicted protein  29.77 
 
 
690 aa  210  5e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02340  lipid particle protein, putative  31.08 
 
 
871 aa  203  5e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_1971  predicted protein  28.91 
 
 
492 aa  183  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59048  predicted protein  29.85 
 
 
617 aa  159  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.717553 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48799  predicted protein  31.43 
 
 
892 aa  150  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45518  predicted protein  30.11 
 
 
918 aa  136  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  26.79 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  28.57 
 
 
256 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  30.85 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  25.74 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  30.53 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  29.29 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  25.32 
 
 
250 aa  66.6  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  24.71 
 
 
293 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  26.54 
 
 
320 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  28.72 
 
 
311 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  27.64 
 
 
306 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  27.64 
 
 
305 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  27.64 
 
 
305 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  28.14 
 
 
302 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  27.64 
 
 
349 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  26.18 
 
 
346 aa  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  27.78 
 
 
315 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  27.78 
 
 
316 aa  64.3  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  26.18 
 
 
346 aa  64.3  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  27.27 
 
 
347 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  27.64 
 
 
308 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  27.27 
 
 
347 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  27.64 
 
 
302 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  27.27 
 
 
306 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  27.27 
 
 
474 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  29.13 
 
 
251 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  26.77 
 
 
358 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  28.21 
 
 
324 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  27.27 
 
 
347 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  26.63 
 
 
318 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  25.65 
 
 
318 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  27.18 
 
 
298 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  27.17 
 
 
319 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  28.28 
 
 
358 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  24.91 
 
 
330 aa  60.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  28.93 
 
 
327 aa  60.5  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  24.7 
 
 
335 aa  60.5  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  26.07 
 
 
252 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  30.97 
 
 
327 aa  57.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  27.32 
 
 
321 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  24.1 
 
 
256 aa  57.4  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  27.64 
 
 
323 aa  57  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  27.18 
 
 
321 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  24.07 
 
 
276 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  25.54 
 
 
311 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  25.81 
 
 
303 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1381  hypothetical protein  26.24 
 
 
883 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  26.15 
 
 
310 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  27.16 
 
 
304 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  26.83 
 
 
321 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  26.7 
 
 
321 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  26.7 
 
 
321 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  26.7 
 
 
321 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  26.7 
 
 
321 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  26.7 
 
 
321 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  26.7 
 
 
321 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  26.73 
 
 
294 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  24.51 
 
 
263 aa  54.3  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  31.63 
 
 
348 aa  54.3  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1377  hypothetical protein  25.74 
 
 
883 aa  53.9  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  26.29 
 
 
306 aa  53.5  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  25.14 
 
 
345 aa  53.5  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1912  patatin  26.98 
 
 
282 aa  53.5  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  25.39 
 
 
334 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  24.52 
 
 
357 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  26.29 
 
 
306 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  23.22 
 
 
909 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  21.99 
 
 
283 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  25 
 
 
317 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  27.27 
 
 
301 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  27.27 
 
 
301 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  25.3 
 
 
287 aa  52  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  21.65 
 
 
283 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  27.27 
 
 
301 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  27.27 
 
 
301 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1574  hypothetical protein  27.27 
 
 
301 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  25.68 
 
 
347 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  25.68 
 
 
347 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  25.45 
 
 
273 aa  51.6  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4233  patatin  32.73 
 
 
245 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  31.82 
 
 
429 aa  50.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  27.23 
 
 
323 aa  50.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  25.13 
 
 
265 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  25.85 
 
 
283 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  24.36 
 
 
317 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  27.19 
 
 
312 aa  50.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>