30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57363 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_57363  predicted protein  100 
 
 
690 aa  1422    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00408  Patatin-like phospholipase domain-containing protein AN0408 (EC 3.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGC2]  48.75 
 
 
749 aa  595  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0593529 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02340  lipid particle protein, putative  50.66 
 
 
871 aa  559  1e-158  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40606  predicted protein  29.54 
 
 
844 aa  246  8e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.238629 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1588  patatin  31.4 
 
 
495 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0196  patatin  32.42 
 
 
482 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.931024 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01713  Patatin family phospholipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08440)  30.75 
 
 
789 aa  231  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0885007  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41292  predicted protein  28.68 
 
 
566 aa  216  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.278724  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45518  predicted protein  35.25 
 
 
918 aa  215  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01156  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily protein  29.77 
 
 
486 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_1971  predicted protein  27.72 
 
 
492 aa  189  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59048  predicted protein  27.65 
 
 
617 aa  168  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.717553 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4077  predicted protein  28.17 
 
 
434 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0147505 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48799  predicted protein  27.09 
 
 
892 aa  140  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  27.5 
 
 
263 aa  53.5  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  23.38 
 
 
256 aa  51.6  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  47.17 
 
 
251 aa  51.2  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  29.82 
 
 
316 aa  47.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  21.74 
 
 
923 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  23.98 
 
 
250 aa  47  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  24.14 
 
 
311 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  24.36 
 
 
894 aa  46.2  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  45.24 
 
 
348 aa  46.6  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  35.59 
 
 
323 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  40 
 
 
346 aa  45.8  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  41.86 
 
 
346 aa  44.7  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  41.86 
 
 
346 aa  44.7  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.73 
 
 
748 aa  44.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  21.65 
 
 
330 aa  44.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  36.67 
 
 
317 aa  43.9  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>