121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_40606 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_40606  predicted protein  100 
 
 		 844 aa  1729    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.238629 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01713  Patatin family phospholipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08440)  42.74 
 
 		 789 aa  416  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0885007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1588  patatin  36.87 
 
 		 495 aa  324  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41292  predicted protein  33.86 
 
 		 566 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.278724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01156  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily protein  32.39 
 
 		 486 aa  247  6.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57363  predicted protein  29.54 
 
 		 690 aa  246  9.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02340  lipid particle protein, putative  29.72 
 
 		 871 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4077  predicted protein  31.36 
 
 		 434 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0147505 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0196  patatin  30.99 
 
 		 482 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_1971  predicted protein  30.49 
 
 		 492 aa  241  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00408  Patatin-like phospholipase domain-containing protein AN0408 (EC 3.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGC2]  28.22 
 
 		 749 aa  220  7.999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0593529 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59048  predicted protein  28.97 
 
 		 617 aa  218  2.9999999999999998e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.717553 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45518  predicted protein  31.47 
 
 		 918 aa  173  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48799  predicted protein  30.61 
 
 		 892 aa  152  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  27.63 
 
 		 250 aa  65.9  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  25.93 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  28.5 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  25.79 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  26.09 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  26.05 
 
 		 305 aa  56.6  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  24.61 
 
 		 346 aa  56.6  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  24.61 
 
 		 346 aa  56.6  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  27.76 
 
 		 334 aa  55.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  25.12 
 
 		 312 aa  55.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  26.61 
 
 		 318 aa  55.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  26.46 
 
 		 318 aa  55.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  26.61 
 
 		 318 aa  55.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  27.04 
 
 		 319 aa  54.7  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  27.94 
 
 		 335 aa  54.3  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  26.61 
 
 		 368 aa  54.3  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  25.65 
 
 		 707 aa  53.1  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.11 
 
 		 748 aa  53.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  22.22 
 
 		 313 aa  53.5  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  27.45 
 
 		 299 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  25.22 
 
 		 302 aa  52.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  25.99 
 
 		 252 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  21.84 
 
 		 327 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  26.89 
 
 		 339 aa  52  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  28.25 
 
 		 272 aa  51.6  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  22.86 
 
 		 303 aa  51.2  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  23.48 
 
 		 330 aa  51.2  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  24.79 
 
 		 638 aa  50.8  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  25.22 
 
 		 323 aa  50.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  26.5 
 
 		 320 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  43.08 
 
 		 378 aa  50.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  30.77 
 
 		 382 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  26.79 
 
 		 334 aa  50.1  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  25.33 
 
 		 327 aa  50.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  26.55 
 
 		 310 aa  49.3  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  48.89 
 
 		 327 aa  49.3  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  25.4 
 
 		 728 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  40 
 
 		 403 aa  48.9  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  24.15 
 
 		 306 aa  48.5  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  26.55 
 
 		 316 aa  48.5  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0018  patatin  19.43 
 
 		 266 aa  48.1  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  41.1 
 
 		 720 aa  47.8  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  22.92 
 
 		 322 aa  48.1  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  30 
 
 		 400 aa  47.8  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  24.15 
 
 		 306 aa  47.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  21.58 
 
 		 386 aa  47.8  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  26.11 
 
 		 263 aa  47.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1235  hypothetical protein  35.8 
 
 		 579 aa  47.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  24.9 
 
 		 310 aa  47.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  26.13 
 
 		 308 aa  47.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  24.89 
 
 		 312 aa  47  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  42.11 
 
 		 348 aa  47.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  24.44 
 
 		 312 aa  46.6  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  32.39 
 
 		 293 aa  47  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  34.78 
 
 		 379 aa  46.6  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  27.12 
 
 		 335 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  25.11 
 
 		 263 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  25.33 
 
 		 746 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  36.59 
 
 		 728 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  37.14 
 
 		 314 aa  46.6  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  36.07 
 
 		 343 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  27.35 
 
 		 381 aa  47  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  27.98 
 
 		 283 aa  45.8  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  22.94 
 
 		 283 aa  45.8  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  46.67 
 
 		 298 aa  46.2  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  25.11 
 
 		 263 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  31.08 
 
 		 418 aa  45.8  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  24.78 
 
 		 311 aa  45.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  45.8  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  26.18 
 
 		 358 aa  45.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  32.39 
 
 		 373 aa  45.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1595  patatin  25.82 
 
 		 310 aa  45.8  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.613745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  32.89 
 
 		 345 aa  45.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  31.34 
 
 		 399 aa  45.8  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  35.59 
 
 		 429 aa  45.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  25 
 
 		 347 aa  45.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  25 
 
 		 347 aa  45.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3179  cyclic nucleotide-binding protein  26.05 
 
 		 639 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  23.25 
 
 		 310 aa  45.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  25 
 
 		 306 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  35 
 
 		 387 aa  45.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  23.67 
 
 		 390 aa  45.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  26.89 
 
 		 748 aa  45.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  38.33 
 
 		 727 aa  45.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  25.33 
 
 		 343 aa  45.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  31.88 
 
 		 379 aa  44.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>