74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0196 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0196  patatin  100 
 
 		 482 aa  986    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01156  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily protein  36.82 
 
 		 486 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1588  patatin  35.8 
 
 		 495 aa  284  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40606  predicted protein  30.99 
 
 		 844 aa  244  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.238629 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02340  lipid particle protein, putative  34.26 
 
 		 871 aa  240  5e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57363  predicted protein  32.42 
 
 		 690 aa  237  4e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01713  Patatin family phospholipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08440)  33.26 
 
 		 789 aa  233  5e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0885007  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00408  Patatin-like phospholipase domain-containing protein AN0408 (EC 3.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGC2]  32.48 
 
 		 749 aa  223  8e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0593529 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41292  predicted protein  30.04 
 
 		 566 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.278724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_1971  predicted protein  29.03 
 
 		 492 aa  196  7e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4077  predicted protein  29.21 
 
 		 434 aa  192  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0147505 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59048  predicted protein  29.85 
 
 		 617 aa  164  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.717553 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45518  predicted protein  28.65 
 
 		 918 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48799  predicted protein  28.03 
 
 		 892 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.64 
 
 		 748 aa  64.7  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  30.06 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  28 
 
 		 346 aa  57  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  28.29 
 
 		 346 aa  57  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  30.65 
 
 		 294 aa  57  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  25.67 
 
 		 315 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  27.51 
 
 		 303 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  25.6 
 
 		 256 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  28.8 
 
 		 301 aa  53.9  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  29.15 
 
 		 324 aa  53.9  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  29.32 
 
 		 306 aa  53.5  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  29.21 
 
 		 241 aa  53.5  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  30 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  30.48 
 
 		 311 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  29.61 
 
 		 308 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  29.32 
 
 		 306 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  27.67 
 
 		 283 aa  52.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  27.92 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  29.63 
 
 		 316 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  27.92 
 
 		 318 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  26.79 
 
 		 313 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  24.19 
 
 		 302 aa  50.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  32.79 
 
 		 310 aa  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  30.47 
 
 		 308 aa  50.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  26.2 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  28.09 
 
 		 335 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  25.62 
 
 		 252 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  27.18 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  27.94 
 
 		 581 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  27.41 
 
 		 583 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  25.32 
 
 		 334 aa  47.8  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  26.34 
 
 		 256 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  29.3 
 
 		 320 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  23.65 
 
 		 250 aa  47  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  27.04 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  29.03 
 
 		 323 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  27.41 
 
 		 319 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  26.74 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  29.26 
 
 		 293 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  27.27 
 
 		 308 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  28.11 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  27.07 
 
 		 263 aa  45.8  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  28.11 
 
 		 347 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  28.11 
 
 		 347 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  23.35 
 
 		 251 aa  45.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  29.33 
 
 		 283 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.68 
 
 		 765 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  26.21 
 
 		 345 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  28.26 
 
 		 302 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  26.86 
 
 		 327 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  27.32 
 
 		 621 aa  44.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  27.17 
 
 		 306 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  27.17 
 
 		 305 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  27.17 
 
 		 305 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  28.65 
 
 		 474 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  30.69 
 
 		 279 aa  43.5  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  27.57 
 
 		 347 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  24.89 
 
 		 275 aa  43.5  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  28.19 
 
 		 294 aa  43.5  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  24.89 
 
 		 312 aa  43.5  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>