262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1588 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1588  patatin  100 
 
 
495 aa  1030    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01156  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily protein  38.67 
 
 
486 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40606  predicted protein  36.87 
 
 
844 aa  325  1e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.238629 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01713  Patatin family phospholipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08440)  35.79 
 
 
789 aa  297  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0885007  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0196  patatin  35.8 
 
 
482 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02340  lipid particle protein, putative  33.86 
 
 
871 aa  251  2e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_1971  predicted protein  32.46 
 
 
492 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00408  Patatin-like phospholipase domain-containing protein AN0408 (EC 3.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGC2]  34.13 
 
 
749 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0593529 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57363  predicted protein  31.4 
 
 
690 aa  239  1e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41292  predicted protein  30.06 
 
 
566 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.278724  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4077  predicted protein  32.43 
 
 
434 aa  225  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0147505 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59048  predicted protein  27.58 
 
 
617 aa  189  9e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.717553 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45518  predicted protein  32.73 
 
 
918 aa  172  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48799  predicted protein  30.75 
 
 
892 aa  142  9e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  28 
 
 
312 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  28.64 
 
 
256 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.75 
 
 
748 aa  66.6  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  25.6 
 
 
303 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  27.23 
 
 
313 aa  65.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  31.6 
 
 
312 aa  65.1  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  24.05 
 
 
301 aa  64.3  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  28.11 
 
 
241 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  28.64 
 
 
327 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  25.74 
 
 
306 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  24.88 
 
 
252 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  25.74 
 
 
306 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  28.34 
 
 
251 aa  62  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  27.99 
 
 
317 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  27.88 
 
 
322 aa  60.5  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  26.7 
 
 
250 aa  60.1  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  26.26 
 
 
277 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  27.36 
 
 
357 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  26.98 
 
 
311 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  27.01 
 
 
327 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  23.14 
 
 
323 aa  57.4  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  27.5 
 
 
294 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  27.66 
 
 
368 aa  56.6  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  29.17 
 
 
345 aa  56.6  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  26.51 
 
 
320 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  26.42 
 
 
291 aa  56.6  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  26.56 
 
 
335 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  25.54 
 
 
247 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  30.77 
 
 
326 aa  56.6  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  28.65 
 
 
327 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  28.72 
 
 
275 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  26.84 
 
 
323 aa  55.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  27.7 
 
 
263 aa  54.7  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  25.27 
 
 
308 aa  54.7  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3179  cyclic nucleotide-binding protein  28.33 
 
 
639 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  28.87 
 
 
315 aa  54.3  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  28.11 
 
 
343 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  25 
 
 
346 aa  54.3  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  28.49 
 
 
310 aa  54.3  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  28.87 
 
 
315 aa  53.9  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  25 
 
 
346 aa  53.9  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  28.12 
 
 
581 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  28.57 
 
 
314 aa  53.5  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  25.93 
 
 
320 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  25.93 
 
 
320 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  27.32 
 
 
348 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  25.93 
 
 
333 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  25.26 
 
 
302 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  28.02 
 
 
373 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  28.99 
 
 
352 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  30.21 
 
 
346 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  23.62 
 
 
330 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  55.56 
 
 
728 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  27.03 
 
 
345 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  27.69 
 
 
390 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  30.54 
 
 
259 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  29.52 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  25.77 
 
 
306 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  28.12 
 
 
583 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0018  patatin  21.43 
 
 
266 aa  51.2  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  21.74 
 
 
293 aa  51.6  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  27.15 
 
 
343 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.71 
 
 
597 aa  51.2  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  26.78 
 
 
298 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  27.81 
 
 
265 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  28.43 
 
 
352 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  54.76 
 
 
728 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  23.84 
 
 
305 aa  50.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  28.06 
 
 
348 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  52.38 
 
 
733 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  47.17 
 
 
727 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  24.46 
 
 
305 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  24.46 
 
 
306 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  24.46 
 
 
305 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  23.53 
 
 
318 aa  50.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  26.73 
 
 
275 aa  50.4  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  25.96 
 
 
621 aa  50.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  52.38 
 
 
728 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  52.38 
 
 
728 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  27.23 
 
 
909 aa  50.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  52.38 
 
 
751 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  41.67 
 
 
410 aa  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  28.26 
 
 
354 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.73 
 
 
765 aa  50.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  28.8 
 
 
250 aa  50.4  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  28.16 
 
 
279 aa  50.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>