16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_59048 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_59048  predicted protein  100 
 
 
617 aa  1268    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.717553 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01713  Patatin family phospholipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08440)  30.39 
 
 
789 aa  246  6e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0885007  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40606  predicted protein  29.2 
 
 
844 aa  218  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.238629 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1588  patatin  27.58 
 
 
495 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02340  lipid particle protein, putative  30.64 
 
 
871 aa  177  5e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_1971  predicted protein  30.1 
 
 
492 aa  173  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57363  predicted protein  27.65 
 
 
690 aa  168  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0196  patatin  29.85 
 
 
482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01156  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily protein  29.85 
 
 
486 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00408  Patatin-like phospholipase domain-containing protein AN0408 (EC 3.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGC2]  27.72 
 
 
749 aa  148  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0593529 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4077  predicted protein  28.93 
 
 
434 aa  148  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0147505 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41292  predicted protein  27.54 
 
 
566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.278724  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45518  predicted protein  31.6 
 
 
918 aa  110  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48799  predicted protein  22.41 
 
 
892 aa  62.4  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  46.51 
 
 
334 aa  45.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  37.7 
 
 
339 aa  43.9  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>