37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE02340 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE02340  lipid particle protein, putative  100 
 
 
871 aa  1792    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00408  Patatin-like phospholipase domain-containing protein AN0408 (EC 3.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGC2]  46.35 
 
 
749 aa  595  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0593529 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57363  predicted protein  50.66 
 
 
690 aa  562  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1588  patatin  33.86 
 
 
495 aa  258  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45518  predicted protein  38.21 
 
 
918 aa  255  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40606  predicted protein  29.72 
 
 
844 aa  253  1e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.238629 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0196  patatin  34.26 
 
 
482 aa  246  9e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41292  predicted protein  30.93 
 
 
566 aa  229  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.278724  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01713  Patatin family phospholipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08440)  31.09 
 
 
789 aa  221  6e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0885007  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01156  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily protein  31.08 
 
 
486 aa  213  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_1971  predicted protein  30.28 
 
 
492 aa  205  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4077  predicted protein  31.94 
 
 
434 aa  195  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0147505 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59048  predicted protein  30.64 
 
 
617 aa  186  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.717553 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48799  predicted protein  32.17 
 
 
892 aa  165  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  44.64 
 
 
256 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  26.83 
 
 
311 aa  52.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  26.96 
 
 
316 aa  52  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  48.15 
 
 
327 aa  51.2  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  45.31 
 
 
298 aa  50.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  25.94 
 
 
299 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.29 
 
 
748 aa  50.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  24.89 
 
 
323 aa  50.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  26.15 
 
 
263 aa  48.9  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  25.68 
 
 
429 aa  48.9  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  42.19 
 
 
403 aa  47.8  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  25.7 
 
 
301 aa  47.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  40.38 
 
 
343 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  48.89 
 
 
302 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  26.15 
 
 
308 aa  46.2  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  38.33 
 
 
317 aa  45.8  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  36.67 
 
 
317 aa  45.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  35.38 
 
 
293 aa  45.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  23.64 
 
 
981 aa  45.1  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  37.5 
 
 
250 aa  45.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  35.53 
 
 
334 aa  45.1  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  44.44 
 
 
348 aa  44.7  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  47.27 
 
 
346 aa  44.7  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>