26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1791 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1791  patatin  100 
 
 		 386 aa  780    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1412  Patatin  39.85 
 
 		 422 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  31.22 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17250  Patatin-like phospholipase  29.34 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0268924 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1775  patatin  26.73 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0946  patatin  31.49 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239636  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  27.34 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6768  patatin  27.74 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.0432181 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1455  patatin  29.32 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000881553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2584  putative lipoprotein  26.14 
 
 		 497 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1399  patatin  26.79 
 
 		 467 aa  57  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0398519  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4248  patatin  28.99 
 
 		 590 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200413  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4118  patatin  28.99 
 
 		 590 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0545  hypothetical protein  49.06 
 
 		 77 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1998  patatin  32.62 
 
 		 459 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2062  patatin  27.8 
 
 		 467 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41292  predicted protein  27.18 
 
 		 566 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.278724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  35.8 
 
 		 1120 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2273  patatin  32.21 
 
 		 471 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0626503  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1566  hypothetical protein  29.09 
 
 		 527 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1623  hypothetical protein  29.09 
 
 		 516 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0076  patatin family protein  27.27 
 
 		 563 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.869707  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1025  patatin  24.1 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0547  hypothetical protein  32.79 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5962  hypothetical protein  41.67 
 
 		 935 aa  43.1  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2266  patatin  29.25 
 
 		 460 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.745618  normal  0.307315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>