18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4248 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4248  patatin  100 
 
 		 590 aa  1217    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200413  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4118  patatin  100 
 
 		 590 aa  1217    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1025  patatin  34.52 
 
 		 453 aa  160  9e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6768  patatin  29.1 
 
 		 498 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.0432181 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1455  patatin  28.8 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000881553 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1399  patatin  26.83 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0398519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1067  patatin  27.47 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.71878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2584  putative lipoprotein  25.08 
 
 		 497 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2062  patatin  30.17 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3515  Patatin  24.73 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2266  patatin  27.73 
 
 		 460 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.745618  normal  0.307315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2273  patatin  25.47 
 
 		 471 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0626503  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1791  patatin  28.99 
 
 		 386 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1998  patatin  25.56 
 
 		 459 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1623  hypothetical protein  25 
 
 		 516 aa  48.5  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1566  hypothetical protein  26.61 
 
 		 527 aa  45.8  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  26.77 
 
 		 336 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1412  Patatin  30.2 
 
 		 422 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.414709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>